问题 请问大家怎么找相关包或工具的原始文献？比如我要找edger包、Tagetsscan、kegg、go等的文献出处。通过百度可以找到一些相关的文献，但不确定，所以咨询下各位老师！

问题 老师，您好！我用mapchart构建染色体图时，构建的图好像不太对，数据检查没问题，到底是哪里错了，还是因为软件的文件丢失，如果是软件的问题是需要重新下载吗？

问题 WGCNA一个模块中找hub基因 我把cytoScapeinput-edges文件输入cytoscape中 用cytohubba计算 但是每次出来的结果都不一样 试了很多遍也不行 求解答 谢谢！

问题 我想问一下，对于MADS-box这种辅助域的Pfam号和DNA-binding的Pfam号不同的基因家族，做成员鉴定的时候，需要下2个种子序列不？

问题 请问大家有没有遇到过这种情况，根据某一模块的MM和GS散点图筛选的hub基因会分布不同的module，也就是说不全在该module下

问题 我想问下我在可视化的时候，部分窗口（点）展示不完全（只展示半个点）我应该怎么调整？点的大小调整过了 还是不行。需要用哪个参数进行调整呀？谢谢各位大佬！

问题 老师您好，我想请问我的种源地不知道，要做群体遗传是不是先做个分子标记，鉴定一下亲缘关系，然后把亲缘关系近的剔除就可以做群体遗传了

问题 docker使用时没法连接虚拟机和自己的电脑硬盘

老师，我昨晚还能正常运行docker。今天上午就不行了。先是在检测provisioner时，无法验证docker的daemon。我没管它，回车，后面将电脑重启。 结果，小鲸鱼出现了。。但是提示连接不成功，被拒绝连接了。应该是虚拟机和我的电...

问题 顺式作用元件分析分析DNA还是RNA水平？分析时一般提取多长序列？

文章 MCScanX 安装报错，支持64位系统

...： 不要切换到root安装，普通用户sudo安装就可以；下游分析程序export CLASSPATH='.:/yourPath/MCScanX-master/downstream_analyses'

问题 执行ALLHiC分组不成功

执行下列命令行： k=5 #设置染色体数目，染色体基数为5 ALLHiC_partition -b sample.clean.bam -r draft.asm.fasta -e DPNII -k $k ## Extract CLM file and counts of restriction sites  #(HindIII: AAGCTT; MboI: GATC) allhic extract sample.clean.bam draft.asm.fasta --RE GATC ## ...

问题 WGCNA分析策略？10个样品，3个时期，如何进行分析？是每个时期对这10个样品进行分析还是30个样品一起分析（总共30个样品，无重复）？

谢谢

问题 老师我用这个脚本文件提取基因的注释信息，为什么只能提取出CDS的位置信息呢，其他如外显子位置信息提取不出来呢？如下图，请问老师这是什么一个原因呢？

问题 请问这两个基因ID不同是有什么区别吗？在后面做筛选的时候，就只能出来基因ID短的，这些基因ID长的筛不出来的原因是什么呢？希望可以回复下

问题 老师您好！我在用samtools获取染色体长度时报错，可能原因时Contig1中的序列长度不一致，这种具体该怎么处理呀？我看了它的序列是图上这种样子的