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文章 基因编辑RAW264.7细胞系—助力炎症以及破骨细胞生成相关研究-源井生物

.../gNLRP3)用于多种炎症性疾病的治疗。 因此,研究者通过调整聚合物中阳离子脂质BHEM-Chol的重量和PEG5K-b-PLGA11K的质量分数,建立了不同表面电荷和PEG密度的基团库。研究者在体外和体内都筛选了家族,并选择了一个更好的家族来...

问题 QTL-seq分析问题

...候选基因是在超出阈值线的区域吗?如果都没有超出,该如何解决,能否适当降低阈值,比如设90%置信区间,该怎么计算。(3)能否给出上面这个图的代码呢,大部分论文都是放的这种图,既然是重现文献课程。(4)BSA的欧...

问题 顺势作用原件功能评估

...is-acting element involved in low-temperature responsiveness。请问老师如何评估这些元件的功能,文中也没有引用参考。我觉得评估这些功能要和基因联系起来,但是WRKY基因功能有限,能有这么多功能吗?还是我理解错了?需要查询含有这...

文章 单细胞转录组数据标准化:

...行每个细胞测序深度的归一化,从而促进更相似的细胞间比较。然而,数据需要进一步缩放,以稳定基因表达水平和方差之间的关系。ScaleData 采用简单的基因水平居中和缩放,这意味着每个基因的均值中心为零,表达值按标准...

文章 让AI帮你处理数据,绘制图表!让你强到可怕!

...来辅助我们的研究。今天要给大家推荐2场超实用的直播课-《让AI帮你绘图》和《让AI帮你处理数据》(限时优惠仅需0.99元),课程围绕 AI等人工智能在多组学数据分析中的强大应用展开,帮你轻松搞定多个重要的组学数据分...

问题 变异结果统计与绘图展示

老师,请问如何修改图片输出的大? vcf_stat.pl     Contact: huangls   Discription:       Usage:         Options:         -vcf    <str>   required, input vcf file to stat;         -type   <str>   required, file type,snp or indel      ...

文章 perl中while循环+each函数遍历哈希易错点

之前在使用perl时遇到一个比较奇怪的错误,程序大概是这样的: while(<IN>){my @line = split("\t",$_);my ($chr,$start,$end) = split(/[\:\-]/,$line[2]);while(my($key,$value) = each %region){my($a,$b,$c) = split(/[\:\-]/,$key);next if($a ne $chr);print "1\n" if($line[0] eq...

问题 BLAST 比对建库

...大数据库的比对后,在hmmsearch第一次搜素结构域时,我的如何对接上?

文章 RunUMAP函数报错,

...rs) :   function 'as_cholmod_sparse' not provided by package 'Matrix' 如何解决?,主要是因为Matrix和irlba的依赖问题,可以通过重装一下后者解决 install.packages("irlba", type = "source") 安装以后重新启动R执行umap代码就可以不需要library,一般来说m...

问题 诱变材料且以自交M6代,可不可以采用 QTL-seq 的方法来定位到基因?

...用 QTL-seq 来分析么?因为 Mutmap 方法需要自交,所以感觉比较费时间,而 QTL-seq 可以筛选到表型后直接混池测序,所以想搞清楚,如果是诱变材料,且诱变材料也自交了M6/M7代 可不可以 用 QTL-seq 分析?为什么?静等老师回复,...

文章 利用单拷贝直系同源基因蛋白序列做分歧时间树mcmctree

...后gap的列后再进行数据分析: 0,不需要,但在序列两两比较的时候,还是会去除后进行比较;        BDparas = 1 1 0.1   * birth, death, sampling;*设置出生率、死亡率和取样比例。若输入有根树文件中的时间单位发生改变,则需...

文章 BLINK(C版本) 进行 GWAS分析的教程

...大讲堂问答社区 (omicsclass.com) ,转换后可能还需要一些调整,成为示例数据的格式。 注:我在运行的时候,有时非数字的染色体名称会导致出错,例如Chr01错误,1正确,大家可先用某一性状自行测试,再进行全部的分析。 ...

问题 抱歉打扰,我在做circos时遇到了下面问题,看到了您也遇到相似问题,想知道您是如何解决的,期待您的回复。

manager@bl8vbox[laccasecircos] /biosoft/circos/circos-0.69-6/bin/circos -conf /home/manager/share/laccasefamily/laccasecircos/config3.txt -outputdir ./ -outputfile ABRE3a debuggroup summary 0.43s welcome to circos v0.69-6 31 July 2017 on Perl 5.018002 debuggroup summary 0.43s current working direc...

文章 win11/win10安装最新版本的docker

...ows子系统 。利用虚拟化技术和Linux内核来实现其功能。相比较于Hyper —V可以提供更快的性能和完全的系统调用兼容性。 具体安装操作: 1. 开启CPU虚拟化 在主板BIOS中打开一下CPU的虚拟化功能。 操作详见教程:https://www.omicscl...

文章 Excel数据分析技巧之方差分析

...。 方差分析最简单的形式就是单因素方差分析,在这里编就为大家介绍使用Excel 2010软件进行单因素方差分析的方法。 注意事项 在使用Excel进行方差分析前,需要确定“工具栏”是否安装了“分析工具库”,若没有安装,则...