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问题 两个群体的snp-index怎么算?

...,我想使用BSA类似的方法可是BSA都是要求混池测序,请问怎么把我同一个群体30个的SNP数据变成一个混池呢?

问题 TCGA中比如说我要下病例报告,slide,还有msi怎么下载?

这个临床数据下载挺全的,但是胃癌相关的:病例报告,slide,还有msi怎么下载? https://www.omicsclass.com/article/1125

问题 转录组WGCNA分析中,要做模块与性状相关性图,怎么定义性状?

请问:现在我取了花蕾的六个发育时期,两个生物学重复,现在怎么定义性状数据?

文章 interpro 查询结构域

...序列,可以是单条,几条,序列太多也可以放入文件,但格式必须是fasta,带>的形式。 点击search,即可进入下图的结构域查询界面。 点击序列名称既可看见该序列包含的结构域。

问题 无参转录组怎么分析?

老师,我购买了有参转录组分析课程,现在需要分析无参的,请问是不是无参的分析流程就是不用基因组比对这一步,直接进行转录组组装。按照有参课程就可以分析,还是说分析流程还有别的区别? 谢谢

问题 mirdeep2预测miRNA时-k的接头序列,如何是双端测序怎么办?

miRNA测序遇到两个问题: 1.mibase数据库小鼠的前提和成熟miRNA参考基因组怎么找?是直接查找下载里边的吗?搜小鼠的该怎么搜索 2.代码中-k 接头序列,如果是Illumina双端测序样本选择P5还是P7,或者是样本的R1R2分开测

问题 jcvi安装报错

ImportError: cannot import name 'HTTPSConnection' 另外还想问一下,docker课程里面是否具备collinearscan软件的安装与使用

问题 请问wgcna怎么获得模块hub基因与该性状数据的相关性

就如上图这样,是提取什么数据来构建这个散点图的。 不知道怎么提取出这些数据,麻烦老师抽空说下。

问题 关于genecode的ID提取

...基因注释,这就使得非编码和编码的都包含了,这个从我打开文本也可以看出是这样的。 然后我想获取编码RNA,我之前没仔细下拉过老师给的那个文本,以为只有protein_coding 今天突然想整下发现。。不太对劲。多了其他一些奇...

问题 circos基因位置不正确

老师您好,就是我在绘制circos图时就是每个基因的位置都是在染色体的最头上,我看了下课程上的文件格式和我的也是一样的,不知道是什么原因,请老师解答。

问题 怎么下载拟南芥中某个基因家族的蛋白序列

问题 怎么样从哈希中一次取出多个值

问题 做BSA时子代混池测序深度怎么确定?

问题 微生物多样性中相对丰富怎么计算的?

问题 像类似图中的pairwise identity的热图怎么画?