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文章 选感兴趣的基因,非编程自行绘制KEGG代谢通路注释图-简单易上手!

...学和系统功能信息的数据库。由日本京都大学生物信息学心的Kanehisa实验室于1995年建立。是国际最常的生物信息数据库之一。 在KEGG分析结果,总还是有人分不清例如K01000和ko01000这样的编号的生物学意义,下面我给大家...

问题 在pfam数据库下载hmm文件的时候到的那个序列号是哪里找的???

在pfam数据库下载hmm文件的时候到的那个序列号是哪里找的??? ncbi? 国知网?? 如何搜索???

问题 Fam_genelist基因个数超出了所有的鉴定的数据

您好,当我发现我的PAV文件不同的fam号对应了同一个基因后,我检查我在32个材料共鉴定了12359个基因,但生成的Fam_gene.list文件基因总数为12436 我尝试了重新跑perl $scriptsdir/PAV_list.pl -pangenel apple.WRKYgene.pan-genes.list -spid new_id...

文章 IF=13.8 | 青藏高原人群肠道微生物生物标志物的荟萃分析及微生物群衍生的丁酸盐在高海拔适应的功能

...示了丁酸在减轻高原环境造成的肠道损伤和缓解缺氧反应的潜在功能。” 高原的极端环境对人体健康构成了严重威胁,暴露在高海拔环境下会导致多种疾病,特别是由肠道损伤引起的胃肠道症状。肠道损伤不仅会导致细菌...

问题 GWAS分析的PCA绘图识别不出来R脚本

按照教程export PATH=$scriptdir:$PATH把这一步添加到了/.bashrc去了,但是还是跑步出来脚本

问题 在提取顺势作元件学习过程遇见的问题

老师,你好,我现在学习基因家族分析这门课程,刚刚学习到预测顺势作元件这节内容,我按照课程一步一步操作的。现在遇见一个问题,如图片红色波浪线所示。才接触这么课程,很多地方不懂,敬请答疑解惑,谢谢!

问题 GPL7280的数据,可以读取进来,处理的过程总是报错,请问这个cdf怎么样能解决?

GPL7280的数据,可以读取进来,处理的过程总是报错,请问这个cdf怎么样能解决?

问题 Treemix分析无法生成input.frq.strat文件

根据正常的流程跑下来,但到第二步的时候发现自己生成的文件只有input.frq,没有生成input.frq.strat文件,这是怎么回事?求老师解答

问题 Treemix分析无法生成input.frq.strat文件

根据正常的流程跑下来,但到第二步的时候发现自己生成的文件只有input.frq,没有生成input.frq.strat文件,这是怎么回事?求老师解答

文章 perl glob函数

perl通过文件操作符glob提供相当于shell的指定多个文件的“通配符”语法功能,文件操作符glob将返回与所指定的glob文件模式相匹配的所有文件的list。 @files = glob "/home/site/*.fasta" 上面的glob的法相当于如下: opendir(Dir,"/home/s...

问题 客服说泛基因组分析26Pan-genes.list对应泛基因集分析章节的final.last.gene.pair.txt文件,但是两者之间有差异,像是缺了几列是怎么回事,如下面详述,请解答

panIDtranstransChrtransStarttransEndtransStrandpanChrpanStartpanEndpanStrandexemplar pan-zea.v1.pan00001Zd00001aa032704_T001Zd-Gigi_PanAnd-1.chr94826216948264952+chr91960330419606076+Zm00001eb376300_T001这是玉米26Pan-genes.list的部分结果。下面的是我自己物种的部分结果 Pangen...

问题 想问一下做药物作后的itraq标记质谱分析蛋白的变化?对照组是113和114,实验组是115,116,117,那如果得到了115/113,116/113,117/113,115/114,116/114,117/114这些都是实验组与对照组倍数变化fold change 以及他们对应的p值,那我怎么,筛选的时候要这六个比值的均值吗?还是有其他的筛选办法?还有六个p值应该如何来筛选?

问题 关于终端使过程显示光标移动的问题

如图,上次docker desktop使失败后,我卸载重下了一遍,但这次在我使终端的过程,却总是出现光标向上一个命令行移动的情况,而且我也没有办法移动它 ,就像是卡住了,但是这个光标却能够继续打字?请问这会是什么原因...

问题 基因组注释提取,gff3_file_to_proteins.pl 序列出错,跟官网给的序列不一致

...酸字母会直接被改成"*",例如: 脚本提取的蛋白序列其一个序列: 而在官网给的蛋白序列fa文件,搜索这一条序列: >ENSBTAP00000002107.8 pep primary_assembly:ARS-UCD1.2:10:91495432:91504569:-1 gene:ENSBTAG00000001605.8 transcript:ENSBTAT0000000210...

问题 你好,我需要这个特征向量关联图的这部分代码,视频没有。