...学和系统功能信息的数据库。由日本京都大学生物信息学中心的Kanehisa实验室于1995年建立。是国际最常用的生物信息数据库之一。 在KEGG分析结果中,总还是有人分不清例如K01000和ko01000这样的编号的生物学意义,下面我给大家...
在pfam数据库中下载hmm文件的时候用到的那个序列号是哪里找的??? ncbi? 中国知网?? 如何搜索???
您好,当我发现我的PAV文件中不同的fam号对应了同一个基因后,我检查我在32个材料中共鉴定了12359个基因,但生成的Fam_gene.list文件中基因总数为12436 我尝试了重新跑perl $scriptsdir/PAV_list.pl -pangenel apple.WRKYgene.pan-genes.list -spid new_id...
...示了丁酸在减轻高原环境造成的肠道损伤和缓解缺氧反应中的潜在功能。” 高原的极端环境对人体健康构成了严重威胁,暴露在高海拔环境下会导致多种疾病,特别是由肠道损伤引起的胃肠道症状。肠道损伤不仅会导致细菌...
按照教程export PATH=$scriptdir:$PATH把这一步添加到了/.bashrc中去了,但是还是跑步出来脚本
老师,你好,我现在学习基因家族分析这门课程,刚刚学习到预测顺势作用元件这节内容,我按照课程一步一步操作的。现在遇见一个问题,如图片红色波浪线所示。才接触这么课程,很多地方不懂,敬请答疑解惑,谢谢!
GPL7280的数据,可以读取进来,处理的过程中总是报错,请问这个cdf怎么样能解决?
根据正常的流程跑下来,但到第二步的时候发现自己生成的文件只有input.frq,没有生成input.frq.strat文件,这是怎么回事?求老师解答
perl中通过文件操作符glob提供相当于shell中的指定多个文件的“通配符”语法功能,文件操作符glob将返回与所指定的glob文件模式相匹配的所有文件的list。 @files = glob "/home/site/*.fasta" 上面的glob的用法相当于如下: opendir(Dir,"/home/s...
panIDtranstransChrtransStarttransEndtransStrandpanChrpanStartpanEndpanStrandexemplar pan-zea.v1.pan00001Zd00001aa032704_T001Zd-Gigi_PanAnd-1.chr94826216948264952+chr91960330419606076+Zm00001eb376300_T001这是玉米26Pan-genes.list的部分结果。下面的是我自己物种的部分结果 Pangen...
如图,上次docker desktop使用失败后,我卸载重下了一遍,但这次在我使用终端的过程,却总是出现光标向上一个命令行移动的情况,而且我也没有办法移动它 ,就像是卡住了,但是这个光标却能够继续打字?请问这会是什么原因...
...酸字母会直接被改成"*",例如: 用脚本提取的蛋白序列其中一个序列: 而在官网给的蛋白序列fa文件中,搜索这一条序列: >ENSBTAP00000002107.8 pep primary_assembly:ARS-UCD1.2:10:91495432:91504569:-1 gene:ENSBTAG00000001605.8 transcript:ENSBTAT0000000210...