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问题 基因组注释提取,gff3_file_to_proteins.pl 序列出错,跟官网给的序列不一致

...酸字母会直接被改成"*",例如: 脚本提取的蛋白序列其一个序列: 而在官网给的蛋白序列fa文件,搜索这一条序列: >ENSBTAP00000002107.8 pep primary_assembly:ARS-UCD1.2:10:91495432:91504569:-1 gene:ENSBTAG00000001605.8 transcript:ENSBTAT0000000210...

文章 IF=4.9 | 多倍体割手密IAA基因家族分析鉴定

...素反应等方面至关重要。割手密(Saccharum spontaneum) 基因组鉴定出92个IAA家族成员,分布在32条(4n)染色体上,并基于系统发育和motif分为三个组,进行基因家族扩张分析。通过顺式作元件预测了参与植物激素调节和应激反应...

问题 BSA分析ED法和SNP-index的方法,哪个更加准确一些?

问题 在转录因子富集分析课程,Q-value 是0,该怎样理解呢?

问题 使virusdetect的过程,出现以下报错命令是为什么?谢谢老师解答

问题 关于在基因组拼接出现的名词hits,pseudomolecule是指什么?求科普

问题 进行hisat比对后,summary文件里出现图片内容,提醒了错如何解决

问题 老师,您好,我目前处于GWAS新手状态,您能叫我下怎么获取数据吗?

问题 GWAS分析,Emmax对于SNP数量是否有要求?

各位大佬好,最近在Emmax进行GWAS全基因组关联分析研究。但发现前面得到的6千万个SNP位点,但在emmax-intel64后仅有前2千万个SNP进行了分析。请问这类软件对于SNP数量有要求吗?

问题 你好,在你描述的tbtolls,生成理化性质之后的Excel文件打不开

问题 docker search omicsclass没有pop-evol-gwas:latest了

问题 安装Linux系统过程出现了不明白的错误 不能打开一个新任务

不太明白这个指令的意思,请问怎么处理?谢谢

问题 基因家族分析基因家族成员的筛选与取舍如何判断?

...法学习基因家族分析课程,到老师教授的木薯的NBS文章的利hmm文件也就是对应基因家族的隐马尔科夫模型筛选得到一个蛋白序列,另外我又采取blast的方式将我要研究的这个物种和其他几个物种的该基因家族序列信息进行...

问题 老师好,基因家族聚类结果怎么统计每个物种这两种情况的基因数量啊,multi_ortholog:该家族在所有物种均存在,且至少在1个物种的成员数大于等于2个;other_ortholog:该家族在至少两个物种存在,且至少在一个物种不存在;

文章 qRT-PCR差异分析及P值计算

...:qRT-PCR相对定量计算详解。 一般在相对定量的最终结果,样本间的差异是以表达差异倍数(Fold change)来展现的,如下图: 那么样品间基因表达差异倍数多少则可以认为有差异呢?回答此问题,我们需要明确差异该如何去...