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文章 课题组如何降低测序成本,加快成果产出

基于高通量测序技术研究手段已经在基因组学、转录组学、表观遗传学等多个领域发挥了巨大作用,同时随着测序成本一降再降,测序已经渐渐变成了一种常规实验手段。 然而有两大问题极大阻碍了科研工作者测序...

文章 CORNERSTONE:用项目管理助推企业转型升级

...开发目。而 CORNERSTONE 恰好适用于这种打破部门边界、基于项目自由组合成员协作场景。 项目组建「虚拟团队」,邀请产品、开发、测试等部门成员加入其中。 打破跨部门协同壁垒,建立高效协同流程 传统只...

文章 两个诺贝尔奖强强联合--CRISPR基因编辑ESC/iPSC应用于再生和个性化医学

...变性,帕金森氏病和糖尿病以及其他退化性疾病。然而,基于人类ESC临床试验极大地受到了限制,例如关于使用胚胎来源细胞伦理问题,以及是用操作不当培养干细胞而导致异常发育,以及移植排斥反应。Takahashi和Yamanaka...

文章 不同物种基因组之间比对与可视化

...演化关系、结构变化、共同基因或 序列以及可能功能元素。基因组比对是生物信息学中非常重要任务,对于研究物种演化、基因功能和结构以及疾病发病机制都有很大帮助。基因组比对过程一般包括以下几...

问题 老师您好,我们在水稻泛基因组数据库https://ricerc.sicau.edu.cn/中下载基因组序列文件,格式不是.fa后缀,可以用来分析吗,是不是需要转换一下格式

下载文件格式是.genome格式

问题 kaks使用phy还是出现not equal如何解决

...少了一部分基因id): 6.两种格式文件aln和phy都格式转换axt 后进行kaks计算都遇到报错not equal, aln格式转化后计算kaks时候如下提示:仅仅输出了一对基因 phy格式转化axt格式,进行kaks计算时候出现如下问题:文件

文章 如何鉴定测序文库是不是链特异性

...到90% 可以认文库是合格。 如果您对转录组数据分析感兴趣,可以学习我两门课程: 《RNAseq有参转录组数据分析》 《转录组数据挖掘》

问题 三代HIFI数据格式

我在公司做三代测序,PACBIO HIFI ,计划做基因组组装。公司提供是原始BAM文件和bam.pbi文件,我需要BAM文件转换成fastq文件才可以组装。请问要怎样才可以转换格式

文章 植物科学常用数据库和生物信息学工具

...和数据库综合平台     http://www.bioinformatics.nl/AraQTL    基于Web用于表达定量性状位点(eQTL)研究工作台和数据库     http://www.plantgdb.org/   植物基因组序列数据库     https://mpss.danforthcenter.org/index.php    二代测序(NGS...

问题 WGCNA分析如何肿瘤TNM分期不同变量转换成数值变量

您好.doc

文章 perl大小写变换函数lc()与uc()

...程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学...

文章 转录组3种分析模式

...一下转录组数据有那些分析模式。 转录组分析模式 基于是否有参考基因组,是否分析转录本,转录组测序分析模式大致可以分成3种类型,如下图: 1. 有参,新转录本发现 针对有参考基因组物种,需要发现...

文章 全面解读第四代基因测序技术

...具概述见表1。 1、碱基识别工具 Metrichor是ONT公司推出基于隐马尔可夫模型进行碱基识别软件。它使用需要网络连接。MinION注册用户需要获得开发者账号才能获得软件代码。2016年初,两个实验室分别开发了Nanocall和Dee...

文章 顺式作用元件基础知识及预测

...验技能! 顺势作用元件预测: 转录因子预测原理是基于序列比对,识别转录因子识别并特异结合目标基因旁侧DNA序列(顺式作用元件),下面介绍一个方便快捷数据库:Plant CARE 。 数据库网址:http://bioinformatics.psb....

问题 老师,您好,我想请问一下,conet分析时,如果不加环境因子时候可以正常运行,但是加上环境因子就不行,想问一下是什么原因?下面是我环境因子格式,我用notepad++转换成文本格式

fatures.xlsx