基于高通量测序技术的研究手段已经在基因组学、转录组学、表观遗传学等多个领域发挥了巨大的作用,同时随着测序成本的一降再降,测序已经渐渐变成了一种常规实验手段。 然而有两大问题极大的阻碍了科研工作者将测序...
...开发目的。而 CORNERSTONE 恰好适用于这种打破部门边界、基于项目自由组合成员的协作场景。 为项目组建「虚拟团队」,邀请产品、开发、测试等部门的成员加入其中。 打破跨部门协同壁垒,建立高效协同流程 传统只...
...变性,帕金森氏病和糖尿病以及其他退化性疾病。然而,基于人类ESC的临床试验极大地受到了限制,例如关于使用胚胎来源细胞的伦理问题,以及是用操作不当培养的干细胞而导致异常发育,以及移植排斥反应。Takahashi和Yamanaka...
...的演化关系、结构变化、共同的基因或 序列以及可能的功能元素。基因组比对是生物信息学中非常重要的任务,对于研究物种的演化、基因的功能和结构以及疾病的发病机制都有很大的帮助。基因组比对的过程一般包括以下几...
下载的文件格式是.genome的格式
...少了一部分基因id): 6.两种格式的文件aln和phy都将格式转换axt 后进行kaks计算都遇到报错not equal, aln格式转化后计算kaks时候如下提示:仅仅输出了一对基因 phy格式转化的axt格式,进行kaks计算时候出现如下问题:文件为空
...到90% 可以认为文库是合格的。 如果您对转录组的数据分析感兴趣,可以学习我的两门课程: 《RNAseq有参转录组数据分析》 《转录组数据挖掘》
我在公司做的三代测序,PACBIO HIFI ,计划做基因组组装。公司提供的是原始的BAM文件和bam.pbi文件,我需要将BAM文件转换成fastq文件才可以组装。请问要怎样才可以转换格式?
...和数据库综合平台 http://www.bioinformatics.nl/AraQTL 基于Web的用于表达定量性状位点(eQTL)研究的工作台和数据库 http://www.plantgdb.org/ 植物基因组序列数据库 https://mpss.danforthcenter.org/index.php 二代测序(NGS...
您好.doc
...程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学...
...一下转录组数据有那些分析的模式。 转录组分析模式 基于是否有参考基因组,是否分析新的转录本,转录组测序的分析模式大致可以分成3种类型,如下图: 1. 有参,新转录本发现 针对有参考基因组的物种,需要发现...
...具概述见表1。 1、碱基识别工具 Metrichor是ONT公司推出的基于隐马尔可夫模型进行碱基识别的软件。它的使用需要网络连接。MinION注册用户需要获得开发者账号才能获得软件的源代码。2016年初,两个实验室分别开发了Nanocall和Dee...
...验技能! 顺势作用元件预测: 转录因子预测的原理是基于序列比对,识别转录因子识别并特异结合的目标基因旁侧的DNA序列(顺式作用元件),下面介绍一个方便快捷的数据库:Plant CARE 。 数据库网址:http://bioinformatics.psb....
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