想请问如何解决没有assay函数的报错？
您好，我在进行结构变异分析的时候，跑完注释这一步代码生成的All.variant_function文件为空，请问该如何解决？我的VCF文件如下图：
如何在Linux系统或者Windows系统中找到基因上游1-1500bp的序列？难道要一条一条的找？还是有代码软件或脚本？
在使用MCSCANX进行绘图时检查了路径和目录 但是一直提示 Could not find or load main class family_circle_plotter 特来请教各位该如何解决
老师您好，我想做某个物种的基因组组装，但是这个物种有野生种、栽培种和地方种，并且这些品种还分不同地区的，例如不同地区的野生种，请问我该如何选择呢？选择的依据是什么？
... 用"K","M","G"来显示文件和目录的大小。 这就是比较常用的ls命令。
您好，在OmicsClass上看到您讲的关于如何使用BinGO的文章，但是我从它的官网上没有找到我所做物种的注释文件，这个注释文件是什么样子的，我现在有我们所做物种的基因ID所对应的GO号的文件，但是这个软件好像不能识别。想...
...一家基因公司为我的病人全家做的全基因组重测序，数据比较多，本人第一次接触遗传和基因组学相关的如此深度的数据，较多疑惑难以明晰，特向专家请教一番，如您有兴趣希望能指导后生一二，可作为后期文章撰写的一份子...
...的集合，包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA、非编码RNA以及小RNA等，不过咱们常说的转录组或者RNA-seq，一般是指狭义上的“转录组”，即指在某一生理条件下所有mRNA的测序。 转录组现在已经是实验必备了，但是你对转录组真的...
老师，用R语言如何对转录组差异基因进行k-means聚类分析，出那种折线图。我在网上百度到的Tcseq包等都是时序的，我的数据是分样本不涉及时序，不知道该怎么做k-means分析的折线图，求助。
... 同时，泛基因组研究可对核心基因组和可变基因组进行比较。泛基因组分析能鉴定出参考序列中不存在的基因，对这些新基因进行功能分析也是其研究的焦点。 更全面准确的变异信息：泛基因组研究可以得到物种全面且准确...
RStudio跑代码时报错，出现“无法分配大小为7.4 Mb的矢量”，释放内存等方法都试过了，如何解决
老师好，在进行基因家族分析时，运行保留蛋白编码基因的脚本，运行过程正常，没有报错，但最后得到的文件却是空的，请问这是什么原因呢？如何解决呢？
...那么空值就读成了NA，需要去除才行； 数据如下，不同比较组的得到的差异基因ID，需要用R绘制韦恩图： 代码及注意事项如下： library(Vennerable) #由于行数不一样，设置fill参数；na.strings 设置空值为NA： All_DEG_venn<-read.table...
通过CNVnator获得的CNV文件，再通过SURVIVOR merge合并获得的VCF格式文件，如何做群体的进化树分析和群体结构，用mega软件的邻接法做不出来。最后问下可以做选择性清除Fst和Pi θπ分析 Tajima's D分析