问题 老师您好，我购买了ceRNA分析的网上课程，在下载TCGA数据时出现问题，提示pre_miRNA_miRBase_v22.tsv文件找不到，想请教下老师这个文件怎么获得，谢谢！

问题 新建物种特异hmm模型，再次搜索，产生的文件round2_hmmerOut.txt中的一个基因序列（下图所示），通过了三大数据库确认。但是序列很短，这个序列不要？

文章 你懂荧光定量PCR吗？要点一二三帮你解惑

...光信号达到设定的阈值时所经过的扩增循环次数。 Q-PCR数据分析·2-ΔΔCt法 内参基因Ct值归一目标基因Ct值：ΔCt(test)=Ct(target, test)-Ct(ref, test)   对照样品ΔCt值归一实验样品ΔCt值：ΔΔCt=ΔCt(test)-ΔCt(control)计算相对表达量：相对表...

文章 一键显示影响因子与分区

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

文章 Perl之stat()函数

...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

问题 SMART网站手动确定结构域没有结果

我鉴定了一个昆虫P450基因家族，在CDD数据库确认结构域大部分基因都有，但是序列提交到SMART数据库全都没有，请问是我鉴定错了还是数据库的问题呢？

文章 linux sort 命令 指定Tab分隔符

...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

问题 我想问一下，什么叫做新的基因，比如说我做的无参转录组，找到的差异基因能在NR数据库中注释到别的物种中，这个算是新的基因吗？

问题 老师，您好！我在网易云课程上学习《微生物16S/ITS/18S/分析原理讲解》课程，我想自己操作，我想跟您要原始数据、qiime命令和R绘图代码可以吗？

问题 老师，有没有一个课程，讲述的是热图中FPKM中的来源，，以及如何运用Linux系统讲述Reads转化为作图需要的FPKM值，以及从哪儿下载得到所需的数据呢？

问题 利用getGEO函数下载GSE数据时提示“Error in open.connection(x, "rb") : cannot open the connection”下载GDS，GPL和GSM都是正常的。

我就觉得奇怪了，下载GDS.GPL和GSM的时候都是正常的，就是这个GSE下载不了，就这样提示，谢谢！

问题 结合转录组分析时，查找GEO号后没有EXCEL下载，只有一个压缩包，里面有三个TXT格式的数据，请问是物种的问题还是别的原因，如果没有问题，这三个txt该如何取舍，谢谢。

问题 我用gemma做小麦的gwas分析，到最后一步生成曼哈顿图时出错，是因为参考基因组的染色体编号与基因型数据对应不上吗，应该怎么老师解答

文章 numpy从文件直接读入得到数组对象

####  numpy数据读取与写出； 测试数据：https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/iris/ import numpy as npimport osos.chdir("D://python_script//")a = np.loadtxt("iris.data", dtype = float64, delimiter=',', usecols = [0, 1, 2, 3])print(a)b = np.loadtxt("iris.data",...

问题 泛基因集构建中JCVI做共线性分析构建完一半数据报错 core dumped

for i in `cat stepmap_ID.txt`;do   # JCVI做共线性分析,--cpus 5 限制计算资源使用，如果不加默认--cpus 56   python3 -m jcvi.compara.catalog ortholog \    pangene ${i} --cpus 5  --no_strip_names --cscore 0.8;   # 以提升后的anchors作为基因对的结果，把比对...