想做个开花基因的家族分析。
老师您好! 我在做植物中某蛋白酶基因家族研究中,取果实不同发育时期的转录组,看基因表达情况,使用log2处理作图,并在图中标注了原FPKM值。 如图中,自上数第2-5个条带,分别是4个基因,FPKM 都在在0-2的小数值,表现为...
从fasta基因组中提取反向互补序列,借助bedtools工具。 bedtools getfasta -fi Dlong_asm_chr.fasta -bed DlNIP.bed -s -fo DlNIP.bed.fa -fi 基因组文件 -bed 基因位置 共6列:【染色体】【基因起始位点】【基因终止位点】【.】【.】【正负链...
请问下这个默认的安装路径算是哪里的空间的,我应该增加哪里的硬盘容量
老师您好,请问图中的问题如何解决啊
例如:geneID.txt,内容如下: 去掉相邻重复的数据行 代码如下: $cat geneID.txt | uniq 得到:
...题,也问住我了。我看绝大多数的文献都是直接从转录组中筛选自己想要的基因,很少有分雌雄的。希望老师能为我解答。
如题
从TCGA下载下来的甲基化数据中,最后一列Feature type ,是对甲基化位点的位置分类。主要包括5类: N_Shelf:CpG岛上游2-4 kbp N_Shore:CpG岛上游0-2 kb CGI: CpG岛 S_Shore:CpG岛下游0-2 kb S_Shelf:CpG岛下游2-4 kbp 其示意图如下: 如...