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问题 hmmer网站搜索蛋白序列中的结构域,得到几个domain,但是序列范围重叠。

hmmer网站搜索蛋白序列中的结构域,如下图,hits found是3即得到3个Thioredoxin domain: thioredoxin、thioredoxin_2、thioredoxin_9,但是序列范围重叠,72-174、85-172、64-173,是什么情况?实际这个蛋白序列中只有一个thioredoxin domain吗? 用NCBI-CDD...

问题 如果用blastp来找到的基因家住成员D或从发表的文献中获知家族成员ID,得到了家族成员列表,后续的基因家族分析中都再用WRKY_domain_new_out_removed_redundant.txt,而不用confirmed_IDlist.txt。我用了一下后者,后续文件提取不成功。如果只有家族成员ID,没有hmmsearch的输出文件,后续的基因家族分析怎么做

问题 运行二次搜索结构域命令的问题

老师,请问我运行这个二次搜索结构域的命令,报错脚本里第四行这个单括号有问题,请问怎么改? manager@bl8vbox[PPR]  script/domain_xulie.pl  PPR_hmm_out.txt  Daucus_carota.ASM162521v1.pep.all.fa  PPR_domain.fa  1.2e-28 script/domain_xulie.pl: 4: script/do...

问题 老师好,想问下将蛋白质序列提交的MEME在线软件后,几天后为什么没有结果啊?显示工作完成,却没有结果,谢谢

问题 基因家族筛选

基因家族的筛选条件具体有哪些?我在重复一篇文章的结果时,发现他鉴定到24个基因,而我通过鉴定发现40多个基因,不懂他是怎么把那20多个舍去的?

文章 pfam上不去 打开后搜索没有反应

pfam数据库一般是可以打开的,但是如果想搜索的话是不行的: Please note: this site relies heavily on the use of javascript. Without a javascript-enabled browser, this site will not function correctly. Please enable javascript and reload the page, or switch to a different b...

文章 吐血推荐!来自科研老司机的国庆7天出游指南!

...为您带来的国庆7天游指南! 科研汪国庆7天出游指南: 发表CNS的:果断欧美豪华游; 发表IF>7的:必须南半球走上一趟呀! 发表IF 3-5的:请选择东南亚游~ 发表IF 1-3的:请选择国内游。 发表IF<1的:省内游适合...

问题 基因家族成员筛选

筛选到的有些成员的保守结构域不完整,但是在UniProt上又有注释,注释为该家族的基因,那我该不该把他们剔除呢

文章 批量搜索替换MySQL数据库中的内容

...k'); 语句如下 发放 以上替换是对所有的student_name 进行搜索替换,如果需要限定特定的数据,后面可以加where限定,如下: UPDATE student SET student_name = replace(student_name, 'John', 'Mark') where id =11;

问题 bioenv环境因子筛选运行10几个小时了 还没出结果 env16个 otu300多 要down重新开始吗 还是选择vif进行筛选

问题 有GO号,用amigo搜索GO注释,能具体点吗?

问题 为什么第一次搜索结构域搜出来是空的?

问题 为什么搜索讲堂的镜像和blast镜像都失败了呢

问题 大家好,我第一次注册分子生态网络MENA账号是总是提示邮箱和账号被用,试了好几次都不行,请求各位大神指点迷津

问题 老师好,我从转录组结果中筛选MYB转录因子,遇到相同的symbol号或者MYB名字,请问做基因家族分析的时候,怎么筛选和过滤MYB呢?