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文章 统计不同样品-生物学重复基因表达量数据合并和绘图统计

1.我的数据介绍: 我这做了 一个对照和处理各取了四个时期的样品进行转录组分析,每个样品3个生物学重复,共24个样品基因表达量数据; stage1stage2stage3stage4controlDAF2 DAF5DAF11DAF16caseGDAF2 GDAF5GDAF11GDAF16 以上是输入数据,CK...

问题 QTL-seq数据分析实操课程中命令中用到的qtlplot,如果不使用docker,怎么下载,从哪里获得

下面命令中用到的qtlplot怎么下载,从哪里下载安装到服务器上,不使用docker的情况下 qtlplot -v qtlseq.RS-blast.clean.vcf.gz -r HitomeboreWT --bulk1ID S-bulk --bulk2ID R-bulk --N-bulk1 20 --N-bulk2 20 -m 0.3 --out qtlseq_SR-blast

文章 用Perl一次性读入文件全部内容

...简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

问题 MCSCAN

老师,你好,在用参考资料提供的拟南芥数据跑MASCAN,跑了两次两次均有报错,报错类型一样。如下图第一次去掉了gene,第二次没有删gene(没用sed -i 's#gene:##' AT.gff和sed -i 's#\.1##' pep.fa这俩命令) 在第一次报错后删除第一次处...

文章 VBox虚拟机鼠标如何在物理机与虚拟机间切换

...简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

文章 博士单身的多吗?调查发现:博士平均恋爱次数是6.87次

...爱经历,然后发现,在恋爱次数上,博士高居榜首!! 从数据上来看,博士中,女博士的恋爱次数更高,平均为7.12次, 男博士只有6.47次,拖了女博士的后腿。。。。 学霸姐姐看到这个数据后的第一反应是: 谁把我的恋爱次数...

问题 老师你好,之前看组学大讲堂关于基因下载的视频,照着步骤做,但是在下载数据的时候一直报错,不知道是什么原因呢?不知道能不能帮忙看一下?谢谢

问题 您好,我在数据库中搜索到了某个物种基因组测序的SRA序列,但没有注释。请问,我可以把它下载下来,就某一个基因家族序列进行注释吗?

问题 请问pfam号一般都是整数的吗,我看到一篇文章里pfam 号是带小数的,但在pfam数据库里只有整数部分,带小数是版本问题吗

问题 请问测序返回的原始数据fq格式文件太大大概12G以上,notpad++和记事本还有editplus都打不开,如果不安装linux系统,有什么软件可以打开查看

问题 老师,我想要下载hgmd的数据库,可是网上找了好久,专业版的需要收价格不菲的费用,公共版的需要学术机构的邮箱,所以只能向您求助

问题 基因家族2.0数据准备,跑完代码后生成新的gff文件会加一列新的id

#设置基因组文件名字变量 genome=Gura_genome.fa gff=Glycyrrhiza_uralensis_Fisch.gene.gff species=Glycyrrhiza_uralensis_Fisch #保留蛋白编码基因 agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl --gff  $gff --attribute biotype --value protein_coding -t '!' -o $species.protein_codin...

问题 老师你好,玉米杂交种进行关联分析代码应该怎么编写,单个性状与基因型数据的。在原有的自交系q,k,qk模型上自改的运行不成功

文章 CORNERSTONE | DevOps平台是如何实现开发效率的双倍提升?

...要应用DevOps精益分析的理念实践。精益分析,本质就是对数据的统计、分析与挖掘。01、数据获取精益分析所涉及的数据应从需求提出到用户访问形成一个端到端闭环。数据的获取需要从业务系统本身以及支撑业务系统的CORNERSTON...

文章 iTOL进化树外层添加圆环

...之前的部分都是格式声明,照抄即可。之后就是添加圆环数据数据分两列,第一列为原始标签,第二列是圆环对应颜色,之间以Ta空格分隔。准备好数据后就可以加到进化树中了。 此外,我们在网易云课堂上有各种教学...