...义: 主成分分析PCA(Principalcomponent analysis)是一种研究数据相似性或差异性的可视化方法,采取降维的思想,PCA 可以找到距离矩阵中最主要的坐标,把复杂的数据用一系列的特征值和特征向量进行排序后,选择主要的前几位...
...件分析;6. 家族内基因表达模式分析(结合转录组或QPCR数据); 从难度上看,掌握基因家族分析内容并不是很难,真正的阻碍是你的犹豫不决,当你还在徘徊时,别人的论文已经见刊了,心动不如行动,想学的赶紧来参加组学...
...家族分析内容1. 基因家族鉴定与分类内容:基于泛基因组数据,鉴定目标基因家族成员,区分核心基因(所有个体共有)和可变基因(部分或单个个体特有)。意义:明确基因家族在不同个体/物种中的保守性和多样性。2. 系统...
测序公司发来的是组装好的测序结果,其中里面有全基因组的序列(fa格式),这用组数据可否进行“基因组重测序分析”课程中讲的snp,indel,sv等分析呢?
1.我的数据介绍: 我这做了 一个对照和处理各取了四个时期的样品进行转录组分析,每个样品3个生物学重复,共24个样品基因表达量数据; stage1stage2stage3stage4controlDAF2 DAF5DAF11DAF16caseGDAF2 GDAF5GDAF11GDAF16 以上是输入数据,CK...
下面命令中用到的qtlplot怎么下载,从哪里下载安装到服务器上,不使用docker的情况下 qtlplot -v qtlseq.RS-blast.clean.vcf.gz -r HitomeboreWT --bulk1ID S-bulk --bulk2ID R-bulk --N-bulk1 20 --N-bulk2 20 -m 0.3 --out qtlseq_SR-blast
...简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...
Pacbio三代全长转录组采用isoseq3 进行了转录本的筛选,聚类和校正之后得到高质量的转录本序列,可以对序列再进行一定的合并操作。 采用cDNA_Cupcaake 文档中提供的cd-hit方案,运行命令如下: cd-hit-est -i <input> -o <output> ...
...爱经历,然后发现,在恋爱次数上,博士高居榜首!! 从数据上来看,博士中,女博士的恋爱次数更高,平均为7.12次, 男博士只有6.47次,拖了女博士的后腿。。。。 学霸姐姐看到这个数据后的第一反应是: 谁把我的恋爱次数...
老师,你好,在用参考资料提供的拟南芥数据跑MASCAN,跑了两次两次均有报错,报错类型一样。如下图第一次去掉了gene,第二次没有删gene(没用sed -i 's#gene:##' AT.gff和sed -i 's#\.1##' pep.fa这俩命令) 在第一次报错后删除第一次处...