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文章 微生物PCA分析和PCOA分析差别

...义: 主成分分析PCA(Principalcomponent analysis)是一种研究数据相似性或差异性的可视化方法,采取降维的思想,PCA 可以找到距离矩阵中最主要的坐标,把复杂的数据用一系列的特征值和特征向量进行排序后,选择主要的前几位...

文章 《基因家族分析实操》直播培训(第二期)火热报名中!

...件分析;6. 家族内基因表达模式分析(结合转录组或QPCR数据); 从难度上看,掌握基因家族分析内容并不是很难,真正的阻碍是你的犹豫不决,当你还在徘徊时,别人的论文已经见刊了,心动不如行动,想学的赶紧来参加组学...

文章 最全泛基因家族分析内容思路都在这里了!

...家族分析内容1. 基因家族鉴定与分类内容:基于泛基因组数据,鉴定目标基因家族成员,区分核心基因(所有个体共有)和可变基因(部分或单个个体特有)。意义:明确基因家族在不同个体/物种中的保守性和多样性。2. 系统...

问题 测序公司发来的是组装好的测序结果,其中里面有全基因组的序列(fa格式),这用组数据可否进行“基因组重测序分析”课程中讲的snp,indel,sv等分析呢?

测序公司发来的是组装好的测序结果,其中里面有全基因组的序列(fa格式),这用组数据可否进行“基因组重测序分析”课程中讲的snp,indel,sv等分析呢?

文章 统计不同样品-生物学重复基因表达量数据合并和绘图统计

1.我的数据介绍: 我这做了 一个对照和处理各取了四个时期的样品进行转录组分析,每个样品3个生物学重复,共24个样品基因表达量数据; stage1stage2stage3stage4controlDAF2 DAF5DAF11DAF16caseGDAF2 GDAF5GDAF11GDAF16 以上是输入数据,CK...

问题 QTL-seq数据分析实操课程中命令中用到的qtlplot,如果不使用docker,怎么下载,从哪里获得

下面命令中用到的qtlplot怎么下载,从哪里下载安装到服务器上,不使用docker的情况下 qtlplot -v qtlseq.RS-blast.clean.vcf.gz -r HitomeboreWT --bulk1ID S-bulk --bulk2ID R-bulk --N-bulk1 20 --N-bulk2 20 -m 0.3 --out qtlseq_SR-blast

文章 用Perl一次性读入文件全部内容

...简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

文章 Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 采用CD-HIT合并转录本

Pacbio三代全长转录组采用isoseq3 进行了转录本的筛选,聚类和校正之后得到高质量的转录本序列,可以对序列再进行一定的合并操作。 采用cDNA_Cupcaake 文档中提供的cd-hit方案,运行命令如下: cd-hit-est -i <input> -o <output> ...

文章 博士单身的多吗?调查发现:博士平均恋爱次数是6.87次

...爱经历,然后发现,在恋爱次数上,博士高居榜首!! 从数据上来看,博士中,女博士的恋爱次数更高,平均为7.12次, 男博士只有6.47次,拖了女博士的后腿。。。。 学霸姐姐看到这个数据后的第一反应是: 谁把我的恋爱次数...

文章 VBox虚拟机鼠标如何在物理机与虚拟机间切换

...简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

问题 MCSCAN

老师,你好,在用参考资料提供的拟南芥数据跑MASCAN,跑了两次两次均有报错,报错类型一样。如下图第一次去掉了gene,第二次没有删gene(没用sed -i 's#gene:##' AT.gff和sed -i 's#\.1##' pep.fa这俩命令) 在第一次报错后删除第一次处...

问题 老师你好,之前看组学大讲堂关于基因下载的视频,照着步骤做,但是在下载数据的时候一直报错,不知道是什么原因呢?不知道能不能帮忙看一下?谢谢

问题 您好,我在数据库中搜索到了某个物种基因组测序的SRA序列,但没有注释。请问,我可以把它下载下来,就某一个基因家族序列进行注释吗?

问题 请问pfam号一般都是整数的吗,我看到一篇文章里pfam 号是带小数的,但在pfam数据库里只有整数部分,带小数是版本问题吗

问题 请问测序返回的原始数据fq格式文件太大大概12G以上,notpad++和记事本还有editplus都打不开,如果不安装linux系统,有什么软件可以打开查看