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文章 如何高效的进行多项目管理?

...项目,而项目要能顺利执行其实并不简单,如果又渉及多单位合作,困难程度又大增。 对项目经理来说,从他们的工作日志片段可以看出每人都有自己悲惨的故事,程度恐怕只有过之而无不及。那我们该如何做好项目管...

文章 NCBI检索叶绿体基因并快速下载

...技巧,可以帮我们节省大量时间和精力。本文就来介绍一快速检索并下载基因序列的方法。 打开NCBI后,选择数据库并输入搜索条件,这里通常搜索的是和分析物种相近的物种,如隶属于同一科或者属的物种,有时候还需要...

文章 WGCNA 根据KME值筛选hub基因

...分很简单,输出所有的基因与模块的KME矩阵,然后筛选每模块中kme最大的前几基因就是hub基因: #mergedMEs是经过相似模块合并之后的最终模块对应的模块特征基因: MEs = mergedMEs #输出结果: datKME=signedKME(datExpr, MEs, outputC...

文章 研究miRNA必备的分析网站汇总!

...NA)微核糖核酸,是真核生物中广泛存在的一种长约21到23核苷酸的RNA分子,可通过多种途径调控基因的表达。目前研究比较清楚的3条调控途径分别是:DNA甲基化,RNA剪切和翻译阻止。在调控基因表达、细胞周期、生物体发育...

文章 史上最有性的论文盘点,你一定没见过!

...论文,分享给大家欣赏:1,最有“脾气”的论文标题《p’》对的,你没有看错,就是一字母——P’,P’是穿透内核的地震波的缩写形式,这篇论文是丹麦的女学者莱曼于1936年发表的,这篇具有划时代意义的论文,在那计...

文章 从NCBI当中SRA数据库中下载高通量测序数据

...库提供的SRA Toolkit 工具包里的prefetch可以下载,但是用这方法下载数据需要经过复杂的设置,而且经常莫名奇妙的下不了,总的来说体验很差。 其实老朋友迅雷也是可以下载的 下面通过一例子介绍如何用迅雷下载SRA数据...

文章 Python 学习(一)

... 整型、浮点型、布尔型、复数型整型:1;2浮点型:a=1.1;b=2.3布尔型:True;False复数型:e=1+1j 2、查看类型 令a=1dir(a) 3、查看数据类型 4、a+=1等于a=a+1 a-=1等于a=a-a5、列表li=[1,2,3,4,5]litype(li) 6、元组 tu=(1,2,3)或tu=1,2,...

文章 NCBI、ENA高通量测序数据下载-fastq数据

国际上著名的综合生物数据库有三,分别为NCBI,ENA,DDBJ ,高通量测序的数据往往会提交到这些数据库,下面分别介绍一下: NCBI|Genbank:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ ;NCBI是由美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnolog...

文章 空间转录组实操课程

...种方法虽然可以提供整体的基因表达图谱,但无法解析单细胞的特异 性基因表达情况。 Single cell RNA sequencing (scRNAseq):空转转录组测序技术的发展,使得研究人员能够对单细胞的基因表达情 况进行测量。通过这种方法,可以...

问题 gffread将gtf转化为fasta报错

命令行: gffread -w classcode.fa -g Genome.fa classcode.gtf 报错:Error: sequence lines in a FASTA record must have the same length! 输入的参考基因组:

文章 plot单独画出pheatmap返回的聚类结果(聚类树)

...借助plot()函数: 默认画法 > plot(list$tree_row) 而有一有趣的函数rect.hclust()可以将hclust结果绘图,并圈选出不同的cluster,譬如设定3cluser: > rect.hclust(list$tree_row,k=3) 得到如下结果: 2、而将hclust结果转换成另类树形图a...

问题 xpclr 软件不能运行

在你们服务器上运行xpclr 软件的时候,找不到这软件,相关的镜像已经下载。 [us002@omicsclass-a02  12:28:18 ~/work/pop_cucu_demo/05.select_sweep/xpclr]$cd  $workdir/05.select_sweepmkdir xpclrcd xpclr## xpclr软件每次只能运行1染色体## 原始的XPCLR分析...

文章 在线绘制差异基因kegg注释图

...红色,下调基因显示为绿色。具体方法是在第三列插入一“if”函数,当第二列值为“up”时输出“red”,否则输出“green”,参数设置详见下图: 这样C2单元格就会显示为“red”,双击该单元格右下角,这样C列就都按上面...

文章 叶绿体/线粒体散在重复序列注释——REPuter

REPuter可注释细胞器如线粒体或叶绿体的散在重复序列(Dispersed repeat),包括4种类型,正向 Forward(F),反向 Reverse (R),互补 Complement (C),回文Palindromic (P)。 REPuter 是在线注释的网站, 详情可参考文献  REPuter: the manifold applications ...

文章 为什么“@微信官方”会突然刷爆朋友圈?如何打造一场爆款活动?

...活动从策划、执行到复盘跟进等全流程的管理,帮助团队更好的规划营销活动。 方案策划及头脑风暴 在CORNERSTONE讨论模块里,针对有争议的话题,可以创建讨论话题,并各自说明自己的观点,也可在WIKI模块里的思维导图中共...