...之外，如何解读实验设计并完整阐述一个故事，又是后期分析的另一项大考验。近期有不少 paper 提到 Cell-Cell communication (Ligand-Receptor)，透过 Ligand-Receptor 推测“细胞群”之间的互动关係。分析细胞通讯的工具很多，比较著名的有...
转录组测序应用越来越普遍，但其存在着数据量庞大，分析结果众多等不利于新手的问题，初次接触者眼花头大是常有的事，今天小编就拿一份典型的有参物种转录组结果文件，来给大家概述下各个文件夹里存放了什么，有什么...
老师您好，我利用TCGA下载了某一癌症的read counts和clinical信息，首先分析出差异基因，然后想利用差异基因进行分子分型，非负矩阵的方法，遇到了困难，主要是对欸夫矩阵不理解，老师您能给讲解一下非负矩阵的用法吗
报错： 用R进行相关性分析的时候出现报错： Error in cor(x, y, use = use, method = method) : incompatible dimensionsCalls: corr.test -> cor 到脚本里看发现报错出现在这个函数里： cor.result <- corr.test(A,B,method = method,adjust = adjust) 原因调查： ...
...程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学...
不知道怎回事，使用bio-linux的meme分析，程序运行完毕，EPS图和缩略图出现了这种情况，请问老师，最有可能是什么发生了问题，
... 100356200 basecaller version: 2.3.0.0.140640 另外尝试了不同的ccs版本都报一样错,有遇到过同样问题的大佬求指教，比较急，谢谢~
我的就卡在了图下那个步骤，我那个Project根本没有FKPM数据，您们这个代码的通用性真的令人头大
...姐姐看了一下，这篇论文首先阐明了屁的产生原理，然后分析了这个自然现象如何一步步变成了社会现象，并成为社会道德评价中被否定的行为。 通篇下来逻辑清晰，观点明确，从生理角度延伸到社会角度，揭发其中的社会学...
老师，请教一个问题： （1）我通过基因家族分析课程19课时的方法，从NCBI下载已知Human 目标基因蛋白序列，获得了XXX.fa 文件。提交到了NCBI-CD-search，获得了如下结果（图一）；提交到Pfam数据库，获得了图二暂未出结果（图二...
... -i expset [-g gene.info] [-t type] [--tpm] [-o outdir]RNA seq 免疫侵润分析. In general values should be TPM-normalized ,not log-transformed.optional arguments: -h, --help show this help message and exit -i expset, --expset expset input g...
...uR方法对样本进行处理。校正批次效应后，通过Shannon指数分析发现，高海拔汉族和藏族人群的肠道微生物组Shannon指数显著高于低海拔汉族人群，但低海拔汉族与低海拔藏族之间没有显著差异。这种差异主要体现在物种丰富度上...
brain <- RunUMAP(brain, reduction = "pca", dims = 1:30)执行降维分析的函数,umpa的时候报错 报错信息如下: Error in irlba::irlba(L, nv = n, nu = 0, maxit = iters) : function 'as_cholmod_sparse' not provided by package 'Matrix' 如何解决?,主要是因为Matrix和irlba...
什么是拟时序分析？拟时序（pseudotime）分析，又称细胞轨迹（cell trajectory）分析。通过拟时序分析可以推断出发育过程中细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程。我们可以理解为在一堆细胞中包含各种各样不同的发育状态的细...