您好,当我发现我的PAV文件中不同的fam号对应了同一个基因后,我检查我在32个材料中共鉴定了12359个基因,但生成的Fam_gene.list文件中基因总数为12436 我尝试了重新跑perl $scriptsdir/PAV_list.pl -pangenel apple.WRKYgene.pan-genes.list -spid new_id...
...简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...
GSM265218 Wounding_6h_vs_0h_KE1 GSM265219 Wounding_12h_vs_0h_KE1 GSM265220 Wounding_24h_vs_0h_KE1 GSM265221 Wounding_48h_vs_0h_KE1 GSM265222 Wounding_6h_vs_0h_KE2 GSM265223 Wounding_12h_vs_0h_KE2 GSM265224 Wounding_24h_vs_0h_KE2 GSM265225 Wounding_48h_vs_0h_KE2 GSM265226 Wounding_6h_vs_0h_B1...
根据WGCNA课程中给的script进行操作的。上面两张图分别显示了run了> install.packages("WGCNA")和# Load the WGCNA package library(WGCNA)之后的代码。 请求帮助,非常感谢!
我使用的命令是这样:hisat2-build -p 2 --ss splicesites.tsv --exon exons.tsv $fa $HISAT2Index; 对应的变量都已经赋值了,报错如下:
...泛的细胞通讯分析软件,包含配体、受体及其相互作用的数据库,可以对细胞间的通讯分子进行全面、系统的分析,以及研究不同细胞类型之间的相互交流及通讯网络。 数据库链接:https://www.cellphonedb.org/ppi-resources cellphoneDB原...
我还是用的保守结构域进行分析的,这种好多0的情况下会被说是错的吗,,只不过把我的物种跟拟南芥放一块(我的物种跟拟南芥是同一个科的),,这种情况下我要怎么解释这种情况呢?,,图片太大我只截了一部分,,,...
输入数据为一个向量,数值范围为0-100+: 统计不同数值范围的数值分布频率,并绘制柱状图,如下所示,并把大于100的数值统计到一个柱子当中: 具体R语言代码如下: 注意本代码的主题为cowplot主题适合SCI文章发表,并设...
...留一个作为基因的代表,此步建议对脚本输出的文件手动筛选,挑选ID: perl script/select_redundant_mRNA.pl mRNA2geneID.txt WRKY_domain_new_out_selected.txt WRKY_remove_redundant_IDlist.txt
在Agilent双通道芯片标准化课程中有如下代码: files = list.files(workdir, pattern = "GSM") files RawData=read.maimages(files=files,source="genepix") show(RawData) 我用的GSE8205的 Scan protocol 为 Axon 4000B scanner. Both the 635nm (red, Cy5) and 532nm (green, Cy3) chan...