问题 如何修改perl脚本，利用id号抽提gff文件中的位置信息？

物种gff文件的信息格式如下：ID号是第二列的 si*G****** perl脚本信息如下： use Getopt::Long; my %opts; use Data::Dumper; GetOptions (\%opts,"in1=s","in2=s","out=s","h");  if (! defined($opts{in1}) ||! defined($opts{in2})||! defined($opts{out}) || defined($opts{h})){ &...

问题 合并提取后的domain序列之后，linux系统中的clustalw不能读出蛋白信息

...件的序列粘贴到一个新建文件中），clustalw不能读出蛋白信息。如下图：第一张图是Sequence Input From Disc输入的WRKY_domain.fa文件，回车后可以出现序列对应的蛋白名称和AA长度；第二张图是Sequence Input From Disc输入的合并后的domain.fa文...

问题 Linux系统中在删除GFF文件ID中不必要信息，如gene:时出现报错

问题 python 版本的MCScanX分析物种之间分共线性时，运行里面的例子时，出现报错信息

问题 查看基因组文件里面有哪些信息时，除了CHr还有NSCAFA等其他的，是为什么呢

问题 我想用两个基因组去比对我的转录组，但公司告知我这两个基因组都没有功能注释信息。

老师：        您好！  我想用两个基因组去比对我的转录组，但公司告知我这两个基因组都没有功能注释信息。 下图是两个基因组gff  gff3文件的截图，我就搞不懂，这里面都有些啥？转录组比对时，所需要的是啥？

文章 pfam数据库介绍及使用

...m.org/ 在该数据库中，提供了以下3个不同层级蛋白质家族信息。 1.family 每个family以PF编号唯一标识，所有的family可以分为以下6种类型： FamilyA collection of related protein regionsDomainA structural unitRepeatA short unit which is unstable in isolation ...

问题 请问怎么能把家族成员的gff3信息从基因组的gff3提取出来

是用perl吗，脚本该怎么写

文章 空间代谢组学|质谱成像技术原理解读

...类、含量和空间分布进行精准测定的技术，扩展了代谢组信息的维度，对生命科学的功能研究具有重要意义。得益于质谱仪器成像分辨率和检测灵敏度的提高，空间代谢组学突破了传统代谢组学信息维度不足的缺点，将组学信息...

文章 KEGG数据库-pathway对应基因的注释信息下载

...3个步骤，我们就可以获得了从蛋白到pathway, 相关的对应信息，通过该注释，我们就可以多不同物种的基因进行pathway 分析。

问题 OMIM数据库位置信息是hg19/GRCH37还是hg38/GRCH38为参考的？

What reference assembly does OMIM use for the genomic coordinates?

问题 求救 为什么我删掉：前的为了与蛋白一致，可不显示转录本信息呢，是我删错了吗，应该删除哪个？

问题 老师，您好！请问我用TBtools将xml文件储存的motif locations信息转化为图片，出现下图情况怎么解决？

问题 老师，请问下如何找寻得到miRNA的原始基因组序列信息？是通过什么生物学手段找寻得到的呀？

问题 在singularity中复现遗传进化中数据过滤时出现以下信息导致clean.vcf.gz大小不符合demo