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问题 关于动植物基因组组装课程mysql_server.sh

课程中myseql镜像是用docker启动的(如下),但是如果用singularity启动,相关的命令参数如何更改?我能查到的是-v对应singularity中的-B,其它-p  --name  -e  -d 该如何修改? mysql_server.sh脚本文件中: #启动镜像 docker run -p 3399:3306...

问题 TCGA下载

docker镜像下载TCGA数据,只得到临床信息, 代码报错

问题 SRA数据下载

我用了omics docker 里SARtools下载数据,但是发现容器无法联网

问题 基因家族分析

在操作界面利用docker search omicsclass命令搜索不到镜像了?原来加的QQ群全部解散了,有问题怎么咨询呢?

问题 镜像下载

您好!我尝试跟着教程执行docker pull omicsclass/pan-gene-family:v1.0命令行时根本下载不了镜像,请问一下您可以发一份本地版本镜像文件吗

问题 镜像安装

老师,您好!我尝试跟着教程执行docker pull omicsclass/pan-gene-family:v1.0命令行时根本下载不了镜像,请问一下您可以发一份本地版本镜像文件吗

问题 泛基因家族分析时,泛基因集构建与家族成员分析用的镜像不同,有区别吗

...做26个玉米基因组的基因家族成员鉴定等分析时,用的是docker run -it -m 3G -v/home/us132/pan-gene-family:/work localhost/omicsclass/pan-gene-family:v1.0镜像,而做泛基因集列表时用的是docker run -it --rm --name pangene --group-add keep-groups -v /home/us132/pangene:/...

问题 nextpolish报错

老师,您好,我用的大讲堂的基因组组装的DOCKER,在用nextpolish的时候提示这样的报错,不知道是什么原因,麻烦看下,谢谢1

问题 nextpolish报错

老师,您好,我用的大讲堂的基因组组装的DOCKER,在用nextpolish的时候提示这样的报错,不知道是什么原因,麻烦看下,谢谢1

问题 aspera下载报错

docker中用aspera下载ENA中的数据,提示授权失败,请教原因和解决方法。

问题 jcvi安装报错

ImportError: cannot import name 'HTTPSConnection' 另外还想问一下,docker课程里面是否具备collinearscan软件的安装与使用

问题 镜像安装,镜像安装

老师,您好!我尝试跟着教程执行docker pull omicsclass/pan-gene-family:v1.0命令行时根本下载不了镜像,请问一下您可以发一份本地版本镜像文件吗

问题 重测序

我在重测序call  SNP 的时候,为什么跑一段时间这个镜像就找不到了?但是任务和文件怎么还在更新? [us001@omicsclass-a06  16:17:00 ~]$docker ps CONTAINER ID  IMAGE       COMMAND     CREATED     STATUS      PORTS       NAMES

问题 kaks转换报错

老师,您好! 我目前是在docker的bio-linux里操作的,我在做aln转换axt格式时老师报错,请问如何解决。说是没权限,但是我已经再root里面给了777权限,但还是报错。

问题 镜像加速接下来怎么操作

看了docker在windows系统和mac系统中安装 - 组学大讲堂问答社区 (omicsclass.com)这个帖子,但页面不一样,不知道接下来怎么操作,求解答,感激。