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问题 在进行转录组分析时,在自己的服务器上怎么使用以下命令,请老师帮忙解答;(没有root权限,docker镜像用不了,想在外部自己的服务器中使用)

agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl;agat_sp_keep_longest_isoform.pl

问题 Error response from daemon: Get "https://index.docker.io/v1/search?q=omicsclass&n=25": unable to connect to 199.59.149.205:443. Do you need an HTTP proxy?

老师,请问一下我docker安装成功,怎么无法search镜像

问题 目的:安装Docker Desktop 1.本人电脑:win10家庭版 2.做了什么:开启CPU虚拟化、开启Hyper-V、获得下载地址、在注册表编辑器中改了Professional、桌面上新建containers.cmd并以管理员身份运行 3.产生结果:c盘内存从7G变成2G,Docker结果显示,磁盘空间不足,……引发异常的上一位置中堆栈跟踪的末尾……,再次点击变成如图一所示, 4.请老师指教呀

问题 docker-GSDS网站出错:Request-URI Too Long The requested URL's length exceeds the capacity limit for this server.

Request-URI Too Long The requested URL's length exceeds the capacity limit for this server.

问题 下载你们的GWAS镜像后,在运行时总卡住,等待一段时间后就报错了,是因为这个镜像没有下载好或者安装正确吗,docker images也可以看到v1.2的版本

问题 要进行单倍型分析,但是镜像不是搭建在2.0版本了,docker pull下载不了,联系客服拿到安装包之后一直报错,解决了一天了也没解决问题,求解求帮助

问题 感谢老师,老师我在安装docker的时候照着您的win10 专业版,也开启虚拟化和hyper。但是我在安装的过程中并没有三个选项,我只勾选了一个选项。而且老师您发的文章docker下载页面已经发生改变我不知道有没有下载正确,安装后无法启动,显示内存太小,我想知道只是我内存的问题嘛还是,我安装和下载也有问题。感谢老师,辛苦您了。

问题 是没有gene-family了嘛

PS C:\Users\Administrator> docker pull omicsclass/gene-family:v1.0.1 What's next:     View a summary of image vulnerabilities and recommendations → docker scout quickview omicsclass/gene-family:v1.0.1 Error response from daemon: pull access denied for omicsclass/gene-family, repository d...

问题 动植物基因组注释问题中重复序列注释的问题

上次提到了提供的docker的images中没有找到repeatmasker的数据库RepeatMaskerLib.h5的问题。紧接着我发现流程中的famdb.py脚本也找不到,这个脚本我再课程提供的脚本文件夹中中没找到,同时我在docker的镜像中也没找到。是不是和RepeatMask...

问题 docker中用cleandata与宿主序列比对得到sam文件这一步出现错误,

输入的命令是for i in `tail -n+2 $datafile/metadata.txt|cut -f1`;do bowtie2 --threads 6 \ -x $host_index/Canis_lupus/wolf \ -1 $workdir/1.host_del_and_qc/cleandata/${i}_1.fastq \ -2 $workdir/1.host_del_and_qc/cleandata/${i}_2.fastq \ -S $workdir/1.host_del_and_qc/cleandata/${i}.bowtie.sam \ --v...

问题 你好,我也遇到了一样的问题:docker里omicsclass的镜像都搜索不到了,然后下载omicsclass/gene-family:v1.0.1也报错,联系客服也没有回应,可以请教一下你是怎么解决的吗

问题 ls ../data/*.fa. |sed -e "s/.fa.//g" -e "s#../data/##g" > ../id.txt执行这条命令的时候,未能得到id.txt文件;2.想问一下:每次关掉putty的时候,都需要重新dockers run进入吗?3.软连接之后发现01.data prepare里面有玉米的数据了如何删除此01.data prepare?4.现在发现需要上传id.txt文件,将11个样本名输到txt文件里面,通过filezilla上传到data,再进行docker run?

问题 群体遗传课程admixture的问题

用课程测试的数据运行admixture的时候,显示segmentation fault. 因为docker镜像omicsclass/reseq里面没有找到admixture,所以用conda install另外安装了admixture。我用docker其他镜像的admixture,也是不行,还是显示segmentation fault。

问题 关于重复序列注释的问题

...ork/biosoft/RepeatMasker/RepeatMasker/Libraries/RepeatMaskerLib.h5;但我docker获得的镜像genome-assembly:v1.0中/share/work/biosoft/却没有RepeatMasker这个文件夹。请问是否是重复序列数据库未放在docker的镜像中?

问题 请问用相同的文件,只是把名字改了一下,然后docker自动把重复的序列删除后,为什么出来的motif不一样啊,然后我又把名字改成不一样的,让他不能过滤掉重复序列,之后生成的就和之前的一样了,是什么回事