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tgsgapcloser报错
谢谢老师，但是比对完之后结果是空的，导致ranco报错，我在单独运行ont数据与基因组比对时就没有出现爆内存的问题，并且我的内存是512gb，是不是ont.fa的数据格式有问题？我是通过seqkit转换的 这是我的ont数据内容： >1d88d7d1-7e1b-441f-9e7b-5772c8a6d99e runid=53c4be9a0b11aaf13ce892d32830ea5e4dda6e0e ch=2823...
回答于 2025-06-05 09:42
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基因组注释问题
还想补充一个问题，因为我的物种是杨树，已经多个基因组公布，我能不能根据他们来进行同源预测，需要的gff文件是什么样的，因为我在phytozome下载的gff3文件打开跟database中的gff内容不一样，还有就是我计划用毛果杨4.1版本做17.liftoff.sh，想问下应该用下图中哪个gff3文件？还有就是18.PASA.sh中est应该用下图中哪个文件...
回答于 2024-12-17 23:42
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