我们有基因家族分析课程,课程会提供所有代码和示例数据。 基因家族 https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?share=1&shareId=1031484705
回答于 2022-02-17 15:12
GWAS的数据需要你自己准备材料进行测序。比如做水稻的:准备300份水稻的自然群体,然后每个样进行全基因组重测序,一般测序10X深度,同时,你要调查300份材料的相关性状,最好是多年多点的性状数据。然后测序数据和性状数据都有了之后,就可以做GWAS关联分析了。当然我们组学大讲堂也提供测序分析服务,如果有兴趣的话,可...
回答于 2022-02-14 11:27
不可行的,因为无参转录组是组装得到的unigene,unigene的数量比实际的基因数量多很多,且序列较短。你进行比对的话,会出现多比对的现象,取舍比较困难。还是建议使用新出的基因组把转录组数据重新分析一遍。 如果你自己会分析的话,自己做一下。不会的话可以交个我们,我们可以代做数据分析。有意向做的话,可以微信联系...
回答于 2021-12-27 16:23
1、M10这个瘤数增多的突变体材料是否稳定纯合? 2、如果稳定纯合,那么可以把这个材料当做一个亲本,另选择一个瘤数较少的材料一起做杂交,构建一个分离群体,然后进行定位 3、定位就简单了,无论混池定位还是做QTL定位均可。
回答于 2021-12-24 08:17
我们的基因家族分析课程中有讲,有兴趣的话可以学习一下。https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?share=1&shareId=1031484705
回答于 2021-12-16 08:35
我们的基因家族分析课程中有讲,有兴趣的话可以学习一下。https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?share=1&shareId=1031484705
回答于 2021-12-16 08:35
blast是不行的,blast会出现多比对或者比对不上的情况,只能把原来的转录组重新分析了。
回答于 2021-12-08 08:55
这个您只能给基因组的作者发邮件索要GFF文件了。否则您自己得做基因的预测注释,这个很麻烦的,新手是搞不定的。即使公司做也麻烦,也不会这么进行操作的。
回答于 2021-08-27 10:28