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在构建RIL群体时，父母本如何选择啊？例如是抗旱品种做母本，还...
一般是从育种的角度进行选择的，如果抗旱品种只有抗性性状较好，而不抗旱的其他性状较好，则选择抗旱品种做供体也就是父本，不抗的做受体也就是母本。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据...
回答于 2018-12-14 16:06
做BSA混池定位时，如果分不清抗感池怎么办？
这种情况，分析时只能付出双倍的工作量，随便设定一个是抗池，另一个是感池，分析一遍，然后反过来再分析一遍。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习...
回答于 2018-11-23 15:55
做WGCNA分析时，modules数量多少时结果较为理想？
这一点没有特定要求，我们可以通过树的分支是否清晰来评价结果的好坏。modules的数量是由样品本身的情况决定的。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习...
回答于 2018-11-15 20:38
构建网络是用所有表达基因还是差异基因？
这个是具体问题具体分析。如果使用所有的基因分析，会导致运算量非常大。而也不是所有的基因在这个实验中都有生物学意义，所以我们会根据具体情况做一些过滤或选取特定的基因来做。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族...
回答于 2018-11-12 08:51
做BSA混池定位时，亲本不纯，还有分离，可以做么？
可以做，但是需要找出做杂交组合时所使用的亲本的性状，比如：父本有分离，做杂交时选取的是绿色叶片的，那么在测序时，父本也要选取绿色的。 当然，结果可能会比较差，这个得看具体的材料、性状以及群体大小等。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：...
回答于 2018-11-02 11:46
WGCNA的样品不少于15个，15个样品考虑重复吗？
15个样本这个是包含了生物学重复，比如5个时间点3个重复。当然，样品数越多，效果越好，15个只是最低要求。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入...
回答于 2018-10-22 19:23
蛋白质组学TMT/Itraq分析中，馏分和上机时长对鉴定的蛋白数量影...
做TMT/Itraq时，同一个平台不同的上机时长和馏分对鉴定的蛋白数量有影响。 但是不同的平台要达到相同的效果的话，馏分和机时是不一样的。 比如：Orbitrap Fusion Lumos平台做7个馏分，每个馏分1个小时就能达到QEplus 18个馏分各1小时的效果。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析...
回答于 2018-10-19 09:44
同一个物种不同基因组做共线性分析的意义
共线性分析可以分析不同版本基因组间的共线性区域和非共线性区域，找出重组区域，也可以矫正不同基因组在组装过程中出现的错误！ 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看...
回答于 2018-10-12 12:18
BSA混池定位
如果有条件的话最好是单株提取DNA，然后等量混合。但是公司提取的话如没有特殊要求，则是混合后提取。不过如果非得让公司单株提取再等量混合的话，相应的提取费用是要客户承担的。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族...
回答于 2018-09-28 13:50
PacBio ISO-Seq可以做转录本定量吗？
PacBio ISO-Seq 对每个样本通过构建多个不同片段长度的文库，对每个片段的文库也测了不同的深度，最终每个文库进行合并分析，因此就比较困难像二代测序一样对数据进行均一化来评估表达水平的RPKM/FPKM
回答于 2018-09-21 16:08