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环状RNA测序严格的建库测序是怎么样的?
严格的环状RNA文库是先去核糖体RNA，再消化线性RNA，只保留环形RNA，然后进一步建库测序。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件...
回答于 2019-04-04 15:22
lncRNA分析结果中，和参考基因组的比对效率比较低，那么我在发文...
如果比对效率较低的话，可以从如实解释一下，说所测材料与参考基因组材料亲缘关系较远等原因导致比对效率过低。或者最保险的方法就是避开这个指标，文章上不说比对效率。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解...
回答于 2019-03-15 09:34
lncRNA分析中：CPC分析／CNCI分析／pfam蛋白结构域分析三种分析...
我们在筛选ｌｎｃＲＮＡ的时候，是取的交集，这样筛选的结果会更加准确可靠。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：...
回答于 2019-03-11 09:42
lncRNA测序，必须要有参考基因组么？
在做lncRNA测序时，严格来说必须要有参考基因组，这样预测出来的lncRNA是比较准确的，且会有一些已知的成熟lncRNA。 但是，如果在无参考的情况下非要做的话，那么假阳性会比较高，并且发现的lncRNA都是未知的。准确率就差很多。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快...
回答于 2019-03-01 11:30
基因表达差异分析是使用FPKM还是用readcounts来计算显著性？
一般情况下，差异计算软件要求输入readcount 更多生物信息课程：1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参...
回答于 2019-02-22 15:42
目前说的全转录组测序是什么？
目前说的全转录组测序是基于两个文库进行测序分析的 1、lncRNA文库，也就是全RNA去除核糖体RNA之后进行链特异性文库构建，主要分析lncRNA、mRNA、环状RNA； 2、小RNA文库，主要分析microRNA 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程...
回答于 2019-02-22 15:39
低深度重测序做遗传图QTL定位于简化基因组测序做遗传图相比有什...
低深度重测序毕竟是重测序，测到的区域更全，理论上覆盖整个基因组，检测到的突变位点会更多，相应的能上图的标记就更多，做QTL定位时结果就会更加精细。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数...
回答于 2019-01-18 15:49
做完GWAS分析有必要做转录组测序进行关联验证么？
如果想发比较好的文章的话，最好针对某几个关联结果较好的性状，分不同的有代表性的材料、分不同的时间点或者处理进行取样，然后进行转录组测序，用以关联验证。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. ...
回答于 2019-01-11 16:28
细菌可以按照无参来做转录组么？
一般来说，原核细菌做转录组测序必须有基因组序列，如果没有的话可以先测一个基因组，然后再做转录组。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读...
回答于 2019-01-08 11:03
BSA分析中ED法和SNP-index的方法，哪个更加准确一些？
无亲本时，只能采用ＥＤ法，但是结果相对粗糙一些，定位的位点会很多，且区间较大，准确度不高 有亲本时，可以同时采用SNP-index和ED两种方法，但是以SNP-index为准。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读...
回答于 2018-12-23 17:39