生信老顽童
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分析方法

蛋白定量之后,做聚类热图就可以达到效果。

回答于 2020-08-06 08:23

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老师您好!我在用samtools获取染色体长度是出错,它报了一个diffe...

最好有报错的截图,输入命令的截图、输入文件的截图。没有报错的截图我们不能品控猜测。

回答于 2020-08-04 22:37

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total RNA测序数据可以用来做miRNA预测分析吗?

首先得确定你的测序数据是什么数据,不同的建库方法得到的数据是不同的。

回答于 2020-08-04 22:37

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老师,共线性分析可以全部用蛋白ID做吗?因为我看视频里面做拟南...

共线性分析是基因组或者基因间共线性,使用的是DNA序列,所以要用基因ID。不过基因ID和蛋白ID一般都是比较一致的。

回答于 2020-08-04 22:36

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我想要tiquxulie.pl和get_gene_id.pl

你是要这两个代码么?在我们的基因家族分析课程里有参考资料下载的地方,你下载一下即可。如果没有学习过我们的课程,建议学习一下:https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?share=1&shareId=1031484705

回答于 2020-08-04 22:35

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老师,您好,我想问一下,公开的RNA-seq数据还有基因组重测序的...

有相应的课程的: 转录组数据分析课程(只针对有参考基因组的): https://study.163.com/course/introduction/1005267042.htm?share=1&shareId=1031484705 基因组重测序数据分析实操课程:   https://study.163.com/course/introduction/1210221805.htm?share=1&shareId=1031484705 

回答于 2020-08-04 08:08

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blast建库比对

建议拟南芥和水稻的都下载下来,然后和你的序列进行blast比对。

回答于 2020-07-31 17:53

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请问如何从无参转录组的fasta数据中,找到一些拟南芥的同源序列...

测序数据是短片段的序列,你可以通过比对看出哪些序列比对上了你的目的基因。不过最好建议你拿你的目的基因和无参转录组组装得到的unigene进行blast,比对率高的可能就是同源基因。

回答于 2020-07-31 09:04

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老师您好,知道拟南芥基因家族名称,也知道成员的基因名,怎样找...

那你下载基因组相关文件:基因组序列文件、cds文件、蛋白序列文件、gff文件,然后根据你的基因名称或者ID把相应的序列提取出来即可。不过整套的基因家族分析建议学习: https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?share=1&shareId=1031484705

回答于 2020-07-28 16:09

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报了基因家族鉴定的课,之前装ova的时候用的是官网的,但是很多...

那你按照课程里讲的重新下载安装一下即可。不要使用官网的,要使用我们组学大讲堂提供的。https://www.omicsclass.com/article/526

回答于 2020-07-28 16:06