老师，您好，我在分析wgcna时，根据您的组学大讲堂的教程，构建无尺度网络时跑出来的power图是这样的，请问我在构建网络的时候应该选择power多大合适呢？powerEstimate给出的值是1，觉得显然不对呀~~o(>_<)o ~~
这个显示的数据是你的结果可能不太适合构建无尺度网络。至于参数的选择直接在R里面查询相关函数了解函数和参数定义再做决定
5 WGCNA power 选择
2 个回答
看是signed还是unsigned，如果是unsigned可以取26，如果是signed要排除批次效应，确认是由样品的生物学意义的差异造成的，可以采用如下经验power。根据你的样品数目和选择样品进行赋值即可。
if (is.na(power)){
power = ifelse(nSamples<20, ifelse(type == "unsigned", 9, 18),
ifelse(nSamples<30, ifelse(type == "unsigned", 8, 16),
ifelse(nSamples<40, ifelse(type == "unsigned", 7, 14),
ifelse(type == "unsigned", 6, 12))
)
)
}