染色体挂载,bwa比对问题

您好,根据基基因组装与注释课程,我在做自己物种染色体挂载时,使用bwa aln 和bwa sampe 参数,提示

Unmatched SAI magic. Please re-run `aln' with the same version of bwa.

重装软件也不管用,这种情况怎么解决?

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

用的是我们的docker镜像吗?不是的话可能是前后用的bwa版本不一致

或者,你这个aln重新跑一下,aln可能没有正确跑完

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