无参转录组是有组装出的序列文件的，已有预测的cds序列，你把碱基序列翻译成蛋白序列就可以了 @桂圆儿
无参转录组是有组装出的序列文件的，已有预测的cds序列，你把碱基序列翻译成蛋白序列就可以了 @桂圆儿
你好，我也在考虑用无参转录组进行基因家族分析，请问你解决了吗？
我遇到的问题是想用hmmer进行分析，但是转录组没有GFF文件或者是蛋白文件，不知道怎样生成？
另外，转录组有注释可以直接利用注释进行挑选基因吗？
期待回复，谢谢
1、建议使用hmmer或者blast比对的方法进行鉴定。
2、通过基因组或者unigene库鉴定的都有意义。
3、无参鉴定出的基因，有可能出现结构域不完整、序列比较短等情况
4、你说的cluster是什么通过什么方法筛选出了的？没有明白。
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