#Fst 群体间多样性差异 vcftools Error: Unknown option:

#Fst 群体间多样性差异

vcftools --gzvcf $gzvcf --fst-window-size $window --fst-window-step $step \

--weir-fst-pop ../wild_popid.txt --weir-fst-pop ../cultivated_popid.txt --out Fst.wild.cultivated

Error: Unknown option: ../wild_popid.txt

默认排序时间排序

1 个回答

omicsgene - 生物信息 2022-01-10 12:38

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

可能前面的变量没有设置：

你运行一下：

echo $step  
echo $window

看看有么有值输出，检查变量设置问题；

建议不要用记事本编辑文件，可能出现linux和windows编码问题导致错误，用notepad++