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想问一下,RNA-seq测序之后,进行snpcalling得到的一些snp位点是杂合的,关联分析时按缺失小于0.2,第二等位基因频率大于0.05过滤后,得到的显著位点正好是杂合位点。想问一下,进行关联分析时,怎么处理的分子数据中的snp杂合位点,是直接当成缺失,还是过滤掉,还是基因型填充,还是直接导入tassel进行关联分析?谢谢各位老师
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omicsgene
- 生物信息
2020-07-17 11:16
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS
直接导入tassel进行关联分析就好了;和位点杂合没关系;
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孙俊生
提出于 2020-07-16 19:37
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