5 stringtie分析后没有基因名字

在用stringtie进行转录本组装拼接定量后,从服务器上下载定量后的文件t_data.ctab文件,打开后发现gene_names一列没有基因名字,在R中用ballgwon包进行差异基因筛选后发现,同样没有基因名字,这是为什么呢?我的参考基因组和注释文件都是从ENSEMBLE网站上下载的。并且我发现我的FC值都比较大,但P值符合<0.05的要求,这样是不是不正常的?attachments-2020-05-a6LSn0pR5ec3444374dd7.pngattachments-2020-05-Q9B31eNg5ec34449f197c.png

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

MSTRG开头的基因是 组装的新基因,没有基因名字的:

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