使用命令提取gene_exon_info.gff文件时,我的OVATE_domain_new_out_removed_redundant.txt里这一列id(图一)只有绿色箭头标的这五个可以被输出(图二),是怎么回事呢?而且之前提取的IDlist(图三)也只有那五个对应在mRNAID下面,其他的都发生了错位,我是手动到excel里面转换过来的,希望老师解答一下,我这是哪一步出了错误,卡在这里很久了。

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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

课前说明,下载完基因组,应该检查一下各个文件中ID之间的对应关系,你可以再看看课程;

我看你的ID是不是处理过;怎么有那么多.1.1.1

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堂七

attachments-2020-04-YELBe7FK5e991901ae845.pngattachments-2020-04-ACaCflCp5e99191f975a0.png补充两张提取IDlist.txt时用到的两个文件
希望老师解答一下

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  • 堂七 提出于 2020-04-17 10:44

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