老师,我的counts值的mRNA表达数据,用limma包之前,需要将表达矩征标准化嘛?

老师,我是去年上的您的线下培训课,我看从GEO里下载的表达矩阵里基因表达量多是有小数位的,我的那个counts值数据都是整数,如果我只想用limma包的话,老师我需要怎么处理一下呢?是log()一下,然后用scale() 吗?麻烦老师了!

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

limma是分析基因芯片的,与counts值没有关系的,你是不是搞错了;

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