共线性mcscanX绘制圈图

attachments-2019-12-r6lAb5Yz5e0ae0807d72a.png路径不知道到底哪里有问题啊,这块一直过不去,文件夹顺序是/home/manager/GD_HF_Mb/my_gene_family/MCScanX/mcscan/,manager,Md.gff在mcscan文件夹里,Md.collinearity在mcscan文件夹里,family.ctl在MCScanX文件夹里,2OG_box_family.txt在MCScanX文件夹里,

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

用 ll 命令检查路径是否存在:  例如:  ll  /home/manager/GD_HF_Mb/my_gene_family/MCScanX/mcscan/AT.gff 如果存在会打印信息,不存在会报错;

再有,如果输入文件的路径都写对了,再把所有的文件都打开看看,染色体ID是否一致,基因ID是否一致;


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