基因家族分析时获取基因与mRNA的对应关系

错误提示:Use of uninitialized value $pid in exists at script/mRNAid_to_geneid.pl line 40, <IN> line 188156

gff文件内容有什么问题

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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

attachments-2019-12-D2eBP9ss5de5c1cd5df27.png你的mRNA有些没有Parent 信息,所以脚本不知道你的mRNA来自于哪个gene,因此报错,你把你GFF文件都看看整理好;

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丶昔阳

attachments-2019-12-3pYLaX9H5de52c5741c0f.png后来我在每行最后都加上了分号 还是不行   

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