老师,你好。在做有参转录组分析,转录本基因表达量出来之后,发现里面找不到我期待的同源基因(ID),不过里面发现了好多MSTRG.这样的ID,问题是这些ID在我的注释文件里根本没有,详细情况如下

attachments-2019-09-NyKDnbQz5d8dc7d3adf2a.png命令如上,产生其中一个(T01)结果如下:attachments-2019-09-UGmGz38D5d8dc86c9bcd3.png找不到我所期待的基因,这是什么原因呀

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

肯定是有的,你检查你定量用的基因组基因注释文件gff或者gtf文件,手动搜索确认一下是否含有这些ID; 

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  • scau_bioinfo 提出于 2019-09-27 16:33