5 重测序时比对率(mapping rate)较低的原因可能有哪些?

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最佳答案 2018-07-22 07:00

:重测序一般采用BWA软件进行序列比对,采用mem算法的默认参数进行比对, 比对率低的主要原因可能是参考基因组组装不好,或者所测材料与使用的参考基因组差异比较大,或者有污染所致。

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