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R语言中转换成dummy dummy-variables 虚拟变量

转换成dummy dummy-variables

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• omicsgene 发布于 2023-12-21 15:11

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GEO数据库挖掘—WGCNA鉴定骨肉瘤转移相关基因

骨肉瘤又称为成骨肉瘤，是一种恶性骨肿瘤，多出现早期转移和高死亡率。更好的研究和探索骨肉瘤早期转移的分子机制将有利于进行癌症的治疗，刚好这里就给大家介绍一篇利用公共数据分析的文献：基于共表达分析鉴定骨肉瘤转移相关基因

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• Daitoue 发布于 2019-10-25 11:38

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基于多数据集分析ANLN在宫颈癌所起到的功能

宫颈癌是造成女性死亡的主要癌症之一，这种妇科肿瘤发病也越来越年轻化。随着时代的发展和进步，我们能够从各大数据库网站找到开放的相关研究数据，包括GEO数据库、TCGA数据库等等。而基于现有...

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• Daitoue 发布于 2019-03-29 11:57

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WGCNA、生存分析、ROC共同筛选biomarker

WGCNA筛选最终Biomarker的过程

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• Daitoue 发布于 2019-01-04 14:39

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采用差异表达基因进行WGCNA分析是不合理的

采用差异表达基因进行WGCNA分析是不合理的

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• microRNA 发布于 2018-12-21 14:45

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TCGA临床数据中的TNM分期，如何转换成WGCNA分析中的性状数据

TCGA临床数据中的TNM分期，如何转换成WGCNA分析中的性状数据

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• microRNA 发布于 2018-12-20 22:32

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WGCNA筛选Biomarker

Biomarker有助于疾病诊断、判断疾病分期或者用来评价新药或新疗法在目标人群中的安全性及有效性。基于WGCNA，对疾病相关的基因表达数据构建网络，鉴定关键模块和hub基因，是筛选Biomarker的有效...

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• Daitoue 发布于 2018-12-07 16:24

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GEO数据与WGCNA--挖掘胶质瘤共表达网络的关键模块与通路

加权基因共表达网络（WGCNA）可以利用基因表达数据，构建出加权的基因共表达网络，从而挖掘协同表达的基因模块，探索基因模块与性状之间的关系。 这种分析方法在生物研究领域中被广泛使用，以...

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• Daitoue 发布于 2018-11-23 12:45

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获取关系矩阵（WGCNA)

在进行WGCNA分析的过程中需要基于表达矩阵转换关系矩阵，结合power值构建邻接矩阵，并由此构建TOM矩阵最终构建网络。在代码实现的过程中往往： 1、计算power值 2、基于power直接利用adjacen...

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• Daitoue 发布于 2018-11-23 10:11

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WGCNA知识点详解-提升你的转录组论文档次

WGCNA基本知识点

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• 生信老顽童 发布于 2018-11-15 20:37

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TCGA 数据进行lncRNA, Gene 的WGCNA 联合分析

TCGA 数据进行lncRNA, Gene 的WGCNA 联合分析

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• microRNA 发布于 2018-09-14 14:22

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WGCNA 根据KME值筛选hub基因

WGCNA 根据KME值筛选hub基因

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• omicsgene 发布于 2018-08-22 11:17

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利用WGCNA分析提升转录组测序文章档次

下面就给大家介绍两篇利用WGCNA分析基因共表达网络来提升文章档次。

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• omicsgene 发布于 2018-07-27 09:51

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TCGA 数据的多组学WGCNA联合分析

TCGA 数据的多组学WGCNA联合分析

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• microRNA 发布于 2018-07-20 10:58

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TCGA和GEO套路文章解说

利用GEO数据TCGA数据筛选疾病相关标志分子，miRNA，mRNA，lncRNA，circRNA等；

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• omicsgene 发布于 2018-06-23 14:08