wgcna

attachments-2019-02-Ivt2cwZZ5c6970ad76226.jpgattachments-2019-02-t7PSk5JZ5c6970b53671b.jpgattachments-2019-02-0t3YfBdG5c6970c22bf03.jpg如图。就是WGCNA关联临床性状之后,我两个模块算出来都有临床相关性,但是做GS和MM的图的时候。黑色模块是-0.0029的cor,而红色模块是0.23。我后面要根据GS>0.2和MM》0.8筛选hub gene,然后做后续分析。黑色的模块还能用来分析吗,是不是要舍弃掉。它的cor实在是低,并且P值>0.05。红色模块是不是还可以继续分析。

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1 个回答

Daitoue

hub基因和GS/MM 散点图的相关性解释上没有直接关系,它指的是模块内连通性高的点,不同的人可能会考虑其他的一些筛选方法,譬如你这里说的GS>0.2和MM》0.8    ,至于分析结果有没有意义,整体上看第一张图(模块和性状相关性热图),和BMI相关性高的也就是这两个模块,且p值在合理范围,建议是可以考虑使用的。


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