老师，请问您们一下，我有使用McScan的经验，但是McScanX的是由方法有些地方不是很懂？ - 组学大讲堂问答社区

5 老师，请问您们一下，我有使用McScan的经验，但是McScanX的是由方法有些地方不是很懂？

$$ blastall -i query_file -d database –p blastp –e 1e-10 –b 5 –v 5 –m 8 –o xyz.blast 是什么意思呢？

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分类：软件工具

最佳答案 2018-08-02 02:00

这条代码是 blast 比对：

query_file：替换自己查询fasta序列文件，使用的是blastp，输入文件为蛋白质序列；

database：输入blast比对数据库文件路径；

xyz.blast：输出文件

其他参数默认照抄就好了

更详细的可观看：《基因家族视频课程》有详细操作说明。

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omicsgene - 生物信息

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS | 采纳率 9% | 回答于 2018-07-18 09:52

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不一样提出于 2018-07-17 19:44