TCGA分析得到的risk score如何用自己的数据进行验证，定量pcr可以吗？

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通过学习TCGA生存分析课程，得到了几个基因的risk score，但现在我想用自己的样本进行验证，是不是必须测序，就用定量pcr可以验证吗，该怎么计算？

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1 个回答

microRNA 2018-10-25 11:10

从TCGA得到的那个risk score 是针对测序数据的，不能直接用于PCR验证，因为两者的表达（单位）不一样。
如果要验证的话，最好能用一些样本的PCR定量数据，从新构建基于PCR数据的risk socre 标准。但是如果没有那么多样本的话，也可以简单的基PCR 数据看看趋势。