TCGA数据生存时间怎么确定?

我从TCGA下载了临床数据,但是怎么得到生存时间,用哪个数据?

[1] "bcr_patient_barcode"                         "additional_studies"                         

 [3] "tissue_source_site"                          "patient_id"                                 

 [5] "bcr_patient_uuid"                            "informed_consent_verified"                  

 [7] "icd_o_3_site"                                "icd_o_3_histology"                          

 [9] "icd_10"                                      "tissue_prospective_collection_indicator"    

[11] "tissue_retrospective_collection_indicator"   "days_to_birth"                              

[13] "gender"                                      "menopause_status"                           

[15] "height"                                      "weight"                                     

[17] "race_list"                                   "ethnicity"                                  

[19] "other_dx"                                    "history_of_neoadjuvant_treatment"           

[21] "vital_status"                                "days_to_last_followup"                      

[23] "days_to_last_known_alive"                    "days_to_death"                              

[25] "person_neoplasm_cancer_status"               "tumor_tissue_site"                          

[27] "tumor_tissue_site_other"                     "histological_type"                          

[29] "days_to_initial_pathologic_diagnosis"        "age_at_initial_pathologic_diagnosis"        

[31] "year_of_initial_pathologic_diagnosis"        "initial_pathologic_diagnosis_method"        

[33] "init_pathology_dx_method_other"              "surgical_approach"                          

[35] "peritoneal_wash"                             "pct_tumor_invasion"                         

[37] "neoplasm_histologic_grade"                   "residual_tumor"                             

[39] "total_pelv_lnr"                              "pln_pos_light_micro"                        

[41] "pln_pos_ihc"                                 "total_pelv_lnp"                             

[43] "total_aor_lnr"                               "aln_pos_light_micro"                        

[45] "aln_pos_ihc"                                 "total_aor.lnp"                              

[47] "postoperative_rx_tx"                         "radiation_therapy"                          

[49] "colorectal_cancer"                           "diabetes"                                   

[51] "horm_ther"                                   "hypertension"                               

[53] "birth_control_pill_history_usage_category"   "pregnancies"                                

[55] "primary_therapy_outcome_success"             "prior_tamoxifen_administered_usage_category"

[57] "has_new_tumor_events_information"            "day_of_form_completion"                     

[59] "month_of_form_completion"                    "year_of_form_completion"                    

[61] "has_follow_ups_information"                  "has_drugs_information"                      

[63] "has_radiations_information"                  "stage_event_system_version"                 

[65] "stage_event_clinical_stage"                  "stage_event_pathologic_stage"               

[67] "stage_event_tnm_categories"                  "stage_event_psa"                            

[69] "stage_event_gleason_grading"                 "stage_event_ann_arbor"                      

[71] "stage_event_serum_markers"                   "stage_event_igcccg_stage"                   

[73] "stage_event_masaoka_stage" 

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最佳答案 2018-09-27 11:05

这个不难,直接上我课程中的代码,你自己看吧。
attachments-2018-09-eIJokk9H5bac3a3941d18.jpg


有兴趣的话,可以学习我的TCGA-生存分析》课程,里面有讲到,如何处理临床数据。

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