5 运行MCScanX后,0 match 0discord

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attachments-2018-08-m7RkVX4P5b76de5603be1.jpg最近在试着用MCScanX做共线性分析,在准备好gff和blast文件,运行MCScanX,结果总是出现如问题所示的结果,两个文件和课程中的文件基本一致,照着网上对下游分析文件夹作了make clean 、ldconfig也只正常一次,看过blast文件中的evalue值,没有发现问题,在gff和blast文件中ID都有不同转录本,即ID后都有.1、.2,两个文件这里也没有差别,ID也不存在空格之类的希望哪位老师有空可以解答一下
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最佳答案 2018-09-22 07:56

第一个截的错误:你所在的目录错误,MCScanX尝试找当前目录下mcscans这个目录,以及AT开头的AT.blast At.gff文件。你确定当前目录下存在我刚说的文件。你的截图我也看不到你当前目录有什么文件,文件是什么样的我都不清楚,无法看出其他原因;

第二个截图是你在自己安装MCScanX软件,截图不全看屏幕上的没有安装成功了;


你的问题信息也不全,我只能解答到这里; 截图不要用拍照,仔细看看我给你的两篇文章吧。

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其它 2 个回答

》(~:~)《

我是在mcscans目录下,尝试寻找mascans AT文件,哈哈,一点小错误,搞了一晚上,纯生物专业,之前没做过其他的语言之类的,麻烦老师了,改回上一级目录就好了

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小不点

我的问题跟你的一模一样,你最后解决了吗?想请问一下怎么解决的

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