一般GEO中的双通道芯片是可以下载到series_matrix.txt文件的,这个文件中我看值应该是去过log2的,我看网站介绍说文件里面的值是Normalized log2 ratio of normalized intensities defined by CH2/CH1,这句话是不是意思是两个样本荧光强度比值取对数之后的数据,如果是的话我可以直接看出基因的差异表达了,我可以直接拿这个数据来作图说明我所研究的基因家族成员发生了差异表达吗?因为在文献中也没有见过这种情况的作图,希望老师指点一下,谢谢老师


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2 个回答

Daitoue

一般提供的都是基于这个能看出来,不过它没有显著性值,差异倍率对数值确实就是根据网站介绍的比值对数结果。

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小不点

老师,实在不好意思,我没太看懂您的这句话,意思是我可以直接用这个值做热图代表我的基因家族成员发生了差异基表达吗

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  • 小不点 提出于 2019-07-09 15:36

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