100 blast2go本地化过程中,导入数据库不全,请问老师是哪一个数据库出了问题?我还想要一份无参GO注释的流程或者手册之类的,谢谢

老师,我按照网上的流程(https://www.plob.org/article/6113.html)进行blast2go本地化,执行以下命令后,我的b2gdb这个文件下并没有作者显示的这么多,请问是哪一个数据库我导入出了问题?有没有无参GO注释的流程或者手册之类的推荐一下?

mysql -s -uroot -p密码 b2gdb < go_monthly-assocdb-data
mysql -uroot -p密码 b2gdb -e "LOAD DATA LOCAL INFILE '/root/blast2go/gene2accession' INTO TABLE gene2accession FIELDS TERMINATED BY '\t' LINES TERMINATED BY '\n';"
mysql -u root -p密码 b2gdb -e "LOAD DATA LOCAL INFILE '/root/blast2go/gene_info' INTO TABLE gene_info FIELDS TERMINATED BY '\t' LINES TERMINATED BY '\n';"

我的数据库里面缺这些文件:evidence_dbxref.MYI、gene_product.MYI、gene_product_count.MYI、gene_product_synonym.MYI、evidence_dbxref.MYD、gene_product.MYD、gene_product_synonym.MYD、gene_product_count.MYD、species.MYI、graph_path.MYI、species.MYD、graph_path.MYD、term_synonym.MYI、term.MYI........gene_product_property.frm、graph_path2term.frm、graph_path2term.frm......等等

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最佳答案 2019-05-22 13:54

我再试最后一次,不行再来找老师们回答

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