WGCNA输出的cytoscape的文件出现格式错误

有单个大文件表现为这样,许多基因ID聚集在一个文件里:
attachments-2019-05-B0pIS7Qd5cd98f8c0b733.jpg多个小文件表现为这样,连通性等格式正确,但是没有基因ID(全显示为NA):attachments-2019-05-T3aeznCD5cd99000e4350.jpg

文件仍是以模块颜色来分的,且都是edges的文件。

代码用的是课程里下载的无性状代码:attachments-2019-05-d9KGUJua5cd9909848001.jpg

十分感谢老师百忙之中的帮助!attachments-2019-05-q7TnwJhy5cda2532193e3.jpg

我用课程的数据做了下,前面的图都还正常,到了这个图,跟我用自己的数据做出来的样子差不多,跟正常图比起来有点。。


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最佳答案 2019-05-14 15:55

不太清楚你的问题出在了那里,我们自己在演示分析的时候并没有第一个那种表格,那个数据的内容明显看着就不对,列名对应的和下方的结果是不对应的,而且根据文件的表头显示,你的文件1和2应该是相同格式的,需要你自己确认代码运行过程中是不是哪一步出错了

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