5 环状RNA分析中,在比对时为什么采用BWA比对方法,而不是采用Bowtie?

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生信老顽童

为了检测到更多的环状RNA,采用了BWA进行比对,同时,在环状RNA鉴定时,CIRI需要利用BWA-MEM算法进行序列比对,寻找Junction Reads,然后根据支持剪切位点的GT-AG信号的Junction Reads作为识别circRNA的依据,利用动态规划算法来检测circRNA。


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  • 提出于 2019-04-04 15:27