5 MEGA构建系统发育树时总是报错 No common sites found

已经筛选好了保守结构域,但是构建系统发育树时总是报错

attachments-2018-07-53FJrs1Z5b59d04da1fd2.jpg老师您好,我想问下我通过hummer得到的蛋白序列用mega构建进化树,出现报错No common sites found,报错之后让我进行Pairwise Distances计算,随后删除带有n/c的序列,随后才能构建进化树,请问下这种情况为什么会出现,应该怎么解决

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最佳答案 2018-08-26 02:00

差异太大,可以删除gap试试; https://www.omicsclass.com/article/221



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其它 1 个回答

smyang2018 - 学生

感觉像是有序列和其他的在进化上的距离太远了,或者说比对匹配度低了

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