差异蛋白的挑选

想请教下,我获取的质谱数据处理出来的蛋白counts数据,能不能用edger包作差异,我没有再对他标准化,因为已经处理好多遍了。理论上转录组和蛋白组不会差那么多吧。

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2 个回答

microRNA
擅长:癌症,转录组,数据挖掘

1. 转录组和蛋白质组的数据,其实相关性不是很好的。

2. 定量蛋白质组的数据,可能不能用edgeR 进行分析,具体原理也不好说。

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belive

好的,谢谢老师。

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  • 提出于 2019-03-18 00:48

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