Daitoue
Daitoue

性别: 注册于 2018-04-20

向TA求助
2400金币数
10420 经验值
67个粉丝
主页被访问 29221 次

373 个回答

0 赞同

我构建了Di19基因家族成员的圆形的进化树,里面包括拟南芥、玉米...

分类一般根据基因更细致的功能 结构之类的进行划分,可以参考meme 的motif分析结果,结合序列结构特征等等,同时阅读大量类似功能划分的文献吧,一般搞专门研究的理解和划分会更容易~

回答于 2019-08-24 10:53

0 赞同

基因染色体定位

绘图超出范围可能影响显示,试试整体比例调整到 cM  

回答于 2019-08-24 10:50

0 赞同

geneid_to_mRNAid.pl

按照提示 检查一下mRNA EPl0RYSA........(图中的显示的)是不是存在gene ID 

回答于 2019-08-24 10:48

0 赞同

老师您好,我想请问一下下面这个热图用R语言绘制(我买的是您这...

颜色设置白红吧,默认的没有的是空白 NA,或者对应了白, 应该和数据也有关系,具体的根据你的数据慢慢调整吧

回答于 2019-08-24 10:45

0 赞同

老师您好,我想请问一下,我在做GEO双通道芯片标准化时遇到下面...

你觉得不对指的是?和课程演示出现的差别是?给出报错的代码

回答于 2019-08-24 10:41

0 赞同

计算RPKM值时,公式中需要用到的基因的转录本的长度值具体是从哪...

可以基于基因组注释文件gff文件中基因及转录本位置信息 整理获取

回答于 2019-08-12 11:24

0 赞同

关于Rstudio最新版本中Biobase和GEOquery安装的问题

3.6版本R: if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GEOquery") bioBase 安装类似: if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Biobase")  如需修改镜...

回答于 2019-08-12 11:20

0 赞同

WGCNA分析中cluster dendrogram图上的module colors只能显示一种...

您好~这个是哪个课程的代码?我这边看着好像不太像组学大讲堂对应WGCNA课程代码?看这个应该是基于一步构建的方法完成分析的 具体的问题检查一下画图输入的各个参数是不是和树以及模块对应~

回答于 2019-08-12 09:47

0 赞同

关于基因芯片affy包rma标准化

啊,这边没有直接指数化过这种处理,因为没有看见文献这么去做过,虽然看着像没什么问题。mas5.0的分析如果符合要求的话可以按照它的方法去获取未对数的结果

回答于 2019-08-09 14:48

0 赞同

WGCNA一个模块中找hub基因 我把cytoScapeinput-edges文件输入cyt...

没试用过这种方法计算,所以不清楚具体的计算情况会怎么样,常规的利用代码就可以了,可参考链接:https://www.omicsclass.com/question/134/answer/140 每个模块都可以获取一个hub基因

回答于 2019-08-09 14:46