Daitoue
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网络分析中在MENA中做出环境因子和OTU之间的联系之后,怎么在Cyt...

下载OTU和OTU对应网络图 导入cytoscape就可以了 具体可以参考:OTU网络图绘制

回答于 2019-09-23 09:47

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求问如何用R或者perl脚本来提取fromNode中包含某些ID的行?下图...

R 脚本读入数据之后 用判断  >0.5直接筛 类似读入之后 赋值给dat  再判断 dat_tmp <- dat[dat$weight>0.5,] 如果不明白推荐:R语言入门

回答于 2019-09-23 09:46

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老师,我想做个转录测序然后进行一些分析实验,我想问一下我应该...

参考一下下面的 点击链接去课程介绍了解具体的情况  转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读  转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,提升你的文章档次,学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析  转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录...

回答于 2019-09-23 09:42

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Tbtools作图问题

好像是滚动鼠标中键可以放大缩小

回答于 2019-09-23 09:28

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芯片数据RNA降解情况

实验平行还可以啊 就是两端稍微降解了点

回答于 2019-09-23 09:24

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老师你好,我购买了“微生物OTU网络图绘制(Cytoscape)”,在sparcc...

缺少module  pandas 这个需要自己安装一下

回答于 2019-09-20 09:54

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N50多少,证明组装的好?这篇由SXR写的文章中的下图是哪一篇文献...

衡量的指标比较多 单看N50的话 肯定是基因组N50越大越好,好比三代测序和二代相比,就是希望片段更完整 组装上获得的结果更准确 这样N50也就越大, 文章图片找文献题目这个估计得看过才能知道

回答于 2019-09-20 09:52

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如何找到差异基因的整体通路以及实现可视化?

不太肯定这个是KEGG的通路图还是Mapman的通路图 但是基本的差异结果想在通路图上进行可视化可以参考mapman的图片绘制和可视化

回答于 2019-09-19 17:49

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老师您好!请问一个处理只有5重复,能用这5个重复在MENA中做16S...

不建议数据样本量过少,网站的案例好像是8个还是几个来着,常规的构建网络建议能多一点样本就多一点样本 因此计算的结果会更准确

回答于 2019-09-19 17:47

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甲基化数据做WGCNA,beta值过低怎么办

这种主要是来源于数据的原因 ,不过这边没有使用过甲基化数据做WGCNA 这个分析主要应用在基因表达数据 也有部分用到蛋白数据或者代谢数据之类的,所以不太清楚甲基化数据是不是适用 当然无论适用与否,beta过低都是输入的数据在无尺度网络构建上有所欠缺,如果非要分析,选择一个比较贴近的即可

回答于 2019-09-19 10:14