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检查数据是否正确时 出现以下错误：> exprSize = checkSets(mult...
这种代码的，最好贴代码运行的图片，包括代码和运行结果的截图完整，而且问题最好归下类别，属于什么分析，用的什么软件包之类的，直接这样贴文字，很难定位你的问题。 如果是查询函数用法，可以使用help("checkSets”) 或者？checkSets 的方式
回答于 2019-03-12 11:38
求MISA ，mVISTA ，mVISTA安装包跟教程
能够找到的相关网站链接，可以参考官方具体的网站说明： MISA : http://pgrc.ipk-gatersleben.de/misa/misa.html mVISTA: http://genome.lbl.gov/vista/mvista/about.shtml 第二个软件的说明详细一点，第一个比较少
回答于 2019-03-11 11:23
烟草的基因组数据除了NCBI还有那儿可以下载到？
可以看看JGI/phytozome https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html# 或者 ensembl植物部分 http://plants.ensembl.org/index.html
回答于 2019-03-11 09:40
如何进行分子调控网络解析？找出下游靶节点，筛选出互作蛋白。
指哪一种调控关系？TF 或者其他的？ 可以参考转录组标准分析后的数据挖掘 它涉及了TF调控 和蛋白互作。
回答于 2019-03-08 09:25
基于MENA构建网络，Cytoscape可视化的时候可以把环境因子数据也...
Cytoscape可视化的功能仅是呈现网络图片，想带入环境因子必须在分析的过程中带入，在分析之后，选择相关性高的对应关系 形成环境因子和OTU的相关性网络，并和原来的OTU共现性网络进行合并。分析可以参考：https://www.omicsclass.com/article/558
回答于 2019-03-07 10:41
ensemble下载的物种GFF文件没有染色体信息该怎么办
肯定有相关染色体或者scaffold信息的，只不过部分基因组组装结果不是很好，可能所有的组装的水平scaffold而已，没组到染色体。可以对比其他的一些基因组网站下载看看，有没有更好的参考基因组
回答于 2019-03-06 14:51
热图
1、热图仅是显示对应数据的情况。绘图时样本量无所谓，但是因为两个样本量会导致热图美观度降低，呈现的效果有限，以基因表达数据为例，色彩变化所对应的数据变化，但是样本量少，你可能很难从图片上看到明显的变化趋势。但是绘图仅是绘图而已。 2、如果涉及热图绘制过程中的聚类分析和显示，建议样本量多，结果才可靠有效...
回答于 2019-03-06 09:28
在绘制circos图时 基因组之间的共线性关系无法用条带状表示
1、基因组上的共现性区块能够呈现明显条带有一个前提是每个区块都比较大，如果位置区间小，即使设置显示条带状也是很细的条带，看着和普通的线可能差不多。（目测可能是你对应的区块起始到终止之间距离比较小） 2、因为提供的配置文件内容比较多，有的时候需要一个一个参数调试，而且前提是保证对应的输入文件等设置没有错...
回答于 2019-03-05 13:23