aspera上传数据的时候老是链接中断,一晚上的时间白白浪费了,怎么办?

aspera上传数据

前面我们介绍了如和用命令行的方法上传高通量测序数据到NCBI的方法,见:https://www.omicsclass.com/article/398

但是,aspera命令行由于连接的原因老是中断,本想着利用晚上的时间上传数据,明天一早就能完成,但是第二天起来发现连接中断了,一晚上时间白白浪费了;

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linux解决办法

如果在Linux当中使用aspera,我们可以把上传的命令,写到sh里面然后批量运行。这里有个技巧,就是把上传命令多copy几遍保存,一旦链接中断下一条命令还可以再运行;

windows解决办法

在windows的dos命令当中其实也可以批量运行命令,如下:

将要上传用到的命令写好,输入的文件都写绝对路径,然后把这条命令保存到一个  .bat 结尾的文本文件当中,记得多复制几遍这条命令,一旦有一条命令连接失败还会有下一条命令继续链接;呵呵,多重保险;

写完保存这个文件,然后双击这个文件windows就可以批量运行了,第一条命令断了,下一条继续连接,多重保险,所以不用担心中途断掉浪费时间了;

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NCBI详细上传视频见:《NCBI和GEO数据库上传课程


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  • 发表于 2018-12-17 22:20
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  • 分类:软件工具

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